| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_180 | = 526 | 0 (0.000) | 61 (0.950) | 40/234 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | Xen14_197 | = 402 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GGTGCCAACTTCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_180/383‑526 | ggTGCCAACTTCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgca < 1:3565926‑M1/150‑7 (MQ=255) tGCCAACTTCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaag < 1:3056638‑M1/150‑9 (MQ=255) gCCAACTTCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaagg > 1:1312746‑M1/1‑141 (MQ=255) ttCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttcttt > 1:2979588‑M1/1‑135 (MQ=255) tCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttg < 1:28372‑M1/150‑17 (MQ=255) tCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttg < 1:1685831‑M1/150‑17 (MQ=255) tCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttg < 1:1685830‑M1/150‑17 (MQ=255) tCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACCGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttg < 1:2445935‑M1/150‑17 (MQ=255) cTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgc < 1:634689‑M1/150‑18 (MQ=255) tttGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATAGTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccg < 1:1629236‑M1/150‑23 (MQ=255) gCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTAGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgtta > 1:1971058‑M1/1‑125 (MQ=255) ccTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgtta > 1:2034980‑M1/1‑122 (MQ=255) tttCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctg < 1:403114‑M1/150‑35 (MQ=255) tttCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaac > 1:3808480‑M1/1‑116 (MQ=255) ccAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtt > 1:2795523‑M1/1‑113 (MQ=255) ccAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtt > 1:205229‑M1/1‑113 (MQ=255) ccAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtt > 1:205231‑M1/1‑113 (MQ=255) ccAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtt > 1:205230‑M1/1‑113 (MQ=255) ccAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCAtctgcaaggttctttgccgccgttaacccgtctggtt > 1:205226‑M1/1‑113 (MQ=255) cacCTGTTATCACTTGACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggc > 1:187386‑M1/1‑108 (MQ=255) cacCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggc > 1:459793‑M1/1‑108 (MQ=255) ccTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTTCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcat > 1:2688468‑M1/1‑106 (MQ=255) cTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatg < 1:2021896‑M1/150‑46 (MQ=255) gTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGACGCCATTCGGTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgac < 1:3540527‑M1/150‑48 (MQ=255) aCTTAACCCATTACTGGGTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgat > 1:2580550‑M1/1‑97 (MQ=255) cTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatg < 1:683159‑M1/150‑55 (MQ=255) aCTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctt > 1:987452‑M1/1‑85 (MQ=255) aCTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctt > 1:987454‑M1/1‑85 (MQ=255) cTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgcttt > 1:618292‑M1/1‑84 (MQ=255) cTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgcttt > 1:618293‑M1/1‑84 (MQ=255) ggCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttat > 1:268173‑M1/1‑82 (MQ=255) ggCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttat > 1:116450‑M1/1‑82 (MQ=255) ggCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatatagtcacgctttat > 1:268171‑M1/1‑82 (MQ=255) atcttGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGCTAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttat > 1:999339‑M1/3‑82 (MQ=255) ttGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgt > 1:1489386‑M1/1‑79 (MQ=255) tgctgcCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgtt > 1:104475‑M1/1‑78 (MQ=255) gctgcCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttt < 1:3392147‑M1/150‑74 (MQ=255) ctgcCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgtttt > 1:1261059‑M1/1‑76 (MQ=255) gTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacga < 1:3319328‑M1/150‑80 (MQ=255) aGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaag > 1:3481138‑M1/1‑69 (MQ=255) tatTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcattttcacgaagctc < 1:2965303‑M1/150‑85 (MQ=255) cccGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctg > 1:2750330‑M1/1‑62 (MQ=255) gagcgaTAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccg > 1:2049360‑M1/1‑54 (MQ=255) gagcgaTAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccg > 1:773131‑M1/1‑54 (MQ=255) gaTAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttac < 1:3138594‑M1/150‑101 (MQ=255) tAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactc < 1:139806‑M1/150‑103 (MQ=255) tAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactga < 1:871897‑M1/100‑53 (MQ=255) aCCCAGTGCACTATGTGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctc < 1:786511‑M1/150‑105 (MQ=255) aCCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctc > 1:1609183‑M1/1‑46 (MQ=255) aCCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgctactctc > 1:2366521‑M1/1‑46 (MQ=255) aCCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgcagttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctc > 1:2104811‑M1/1‑46 (MQ=255) cccAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctcc > 1:3451537‑M1/1‑45 (MQ=255) ccAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgttttgtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctccg < 1:2739107‑M1/150‑107 (MQ=255) ccAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtggtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctccg < 1:2739111‑M1/150‑107 (MQ=255) ccAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctccg < 1:2739108‑M1/150‑107 (MQ=255) gCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctccggactc > 1:3131093‑M1/1‑39 (MQ=255) aCTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctccggactccg > 1:2498263‑M1/1‑37 (MQ=255) aCTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctccggactccg > 1:853341‑M1/1‑37 (MQ=255) aCTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgcagttactctccggactccg > 1:2817614‑M1/1‑37 (MQ=255) cTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggttctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctccggactccgc < 1:1660404‑M1/150‑115 (MQ=255) cTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCtctgcaaggtcctttgctgccgttaacccgtctggtttgggcatgacactgatgtagtcacgctttatcgttttcacgaagctctctgctatgccgttactctccggactccgc < 1:965304‑M1/150‑115 (MQ=255) | GGTGCCAACTTCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACACCTGTTATCACTTAACCCATTACTGGCTTGCTGCCGTAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGTGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_180/383‑526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |