| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | Xen14_68 | = 16345 | 0 (0.000) | intergenic (+65/–) | rph/– | Ribonuclease PH/– | |||||
Only 100 of 458 total aligned reads displayed.
GTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/480‑629 | gTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGa > 1:1233412/1‑150 (MQ=255)gTTCCATCGGGTGTGCGCCAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGa > 1:2657050/1‑150 (MQ=255) tCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGacc > 1:1943519/1‑148 (MQ=255) tCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAac < 1:327809‑M1/150‑3 (MQ=255) 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aTCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAacccccagcctagctgggggttttctgtgcacaagaagagctcgtacgaaagtacgagctttttttcgtatattgcatacaccggggggatgagaagccccga > 1:618693‑M1/1‑47 (MQ=255) | GTTCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/480‑629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |