| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | Xen14_168 | = 629 | 0 (0.000) | 297 (0.510) | 96/222 | 0.0 | 100% | intergenic (‑111/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– |
| ? | Xen14_68 | = 16345 | 0 (0.000) | intergenic (+65/–) | rph/– | Ribonuclease PH/– | |||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
TCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/482‑629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGAT < Xen14_68/16345‑16236 TCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAAC < 1:3314972/150‑1TCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAAC > 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ATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCC > 1:2651875/1‑150 ATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTGTTGATTTCTTGTTTAACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTGAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCC < 1:1645520/150‑1 TCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCC < 1:2215237/150‑1 CGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTCGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCA > 1:2978003/1‑150 GGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAG < 1:1838869/150‑1 GGTGTGCGCTACGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATACCTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGC > 1:918249/1‑150 GGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGC < 1:482470/150‑1 GGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGC < 1:1427462/150‑1 GTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCC < 1:2850049/150‑1 TGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACACCCAGCat > 1:3782371/1‑148 TGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG < 1:698249/150‑1 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> 1:280493/1‑146 ATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCAC > 1:801347/1‑145 TTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGACCCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAg < 1:3674813/150‑2 TTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAA < 1:3437736/150‑1 TGGGACCCCCGTTTGATTTCGTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAT‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAA < 1:2812191/150‑1 GGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACAGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCAC > 1:3627332/1‑141 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TTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAA > 1:3401332/1‑150 TTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCCGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAA > 1:2548952/1‑150 ctttCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAG < 1:1007939/146‑1 CTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTG < 1:3814764/110‑1 CTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCGTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAG > 1:3078871/1‑150 AGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGC > 1:2150524/1‑150 GCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTG > 1:1700009/1‑145 CAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAACGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGC > 1:1405486/1‑150 CAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTTTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGC > 1:174971/1‑150 CAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCATTTTGCCAGCGC < 1:667710/150‑1 CAGACCGCAAGGTGTTTTAAAAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGC < 1:1530456/150‑1 AGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTG < 1:143279/150‑1 GTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTC > 1:1983802/1‑150 GTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTC < 1:2351485/150‑1 GTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTC < 1:1188383/150‑1 TTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCCGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGC < 1:1059307/150‑1 TTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCT > 1:2119277/1‑150 TAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTA > 1:1568889/1‑150 TAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTA > 1:905507/1‑150 AAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAAT > 1:2494363/1‑150 ATCAAAAGGGGTTTTAATGACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGG < 1:3460751/150‑1 CAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGAACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGAT > 1:2198226/1‑150 TCCATCGGGTGTGCGCTAAGCTCTTTTCGTTCCCCATTGGGACCCCCTTTTGATTTCTTGTTTGACACTTGCAGTTGCCAGACCGCAAGGTGTTTTAACAAATCAAAAGGGGTTTTAATAACTGGCTCAAAGCTGAAAGCTTTCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_168/482‑629‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttttaataactggctcaaagctgaaagctttccggaACCCCCAGCCTAG‑CTGGGGGTTTTCTGTGCACAAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGAT < Xen14_68/16345‑16236 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |