| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_13 | = 98318 | 0 (0.000) | 44 (0.080) | 27/218 | 1.4 | 100% | intergenic (+227/–) | gltI/– | Glutamate/aspartate import solute‑binding protein/– |
| ? | Xen14_168 | = 590 | 0 (0.000) | intergenic (‑72/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– | |||||
CCCCATCGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_13/98170‑98318 | ccccATCGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTGGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCc < 1:1534654‑M1/150‑2 (MQ=255) cGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAGAACCCcttttga > 1:1344520‑M1/1‑143 (MQ=255) cGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttga > 1:3429112‑M1/1‑143 (MQ=255) gggCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgat < 1:1345925‑M1/150‑9 (MQ=255) ccTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttg > 1:2727286‑M1/1‑139 (MQ=255) ccTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttg > 1:3479379‑M1/1‑139 (MQ=255) ccTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttg > 1:735081‑M1/1‑139 (MQ=255) ccTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttg > 1:735082‑M1/1‑139 (MQ=255) tGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgtt < 1:779260‑M1/150‑14 (MQ=255) aaaaCCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttag < 1:1453403‑M1/150‑16 (MQ=255) aaaCCGCAATGCGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaa > 1:1914399‑M1/1‑134 (MQ=255) aaaCCGCAATGCGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaa > 1:1914400‑M1/1‑134 (MQ=255) cGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacac < 1:367908‑M1/150‑21 (MQ=255) cGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacac < 1:367906‑M1/150‑21 (MQ=255) cTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTTTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTGAAACACcttttgatttgttaaaacaccttgcggtc > 1:3547713‑M1/1‑121 (MQ=255) gggTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctg > 1:439207‑M1/1‑119 (MQ=255) gggTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctg < 1:3062892‑M1/150‑32 (MQ=255) gggTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctg > 1:1390546‑M1/1‑119 (MQ=255) ggTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctgg < 1:2219939‑M1/150‑33 (MQ=255) gTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggc < 1:1827333‑M1/150‑34 (MQ=255) gTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggc < 1:1827340‑M1/150‑34 (MQ=255) gTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggc < 1:1827339‑M1/150‑34 (MQ=255) gTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggc < 1:1827338‑M1/150‑34 (MQ=255) tAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggca > 1:855811‑M1/1‑116 (MQ=255) cAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaact > 1:3217816‑M1/1‑113 (MQ=255) gggTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtca > 1:2128342‑M1/1‑103 (MQ=255) gggTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtca > 1:2128341‑M1/1‑103 (MQ=255) ggTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaa < 1:702517‑M1/150‑49 (MQ=255) ggTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaa < 1:702518‑M1/150‑49 (MQ=255) tAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaac < 1:1914104‑M1/150‑51 (MQ=255) gCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaa > 1:2276134‑M1/1‑98 (MQ=255) gCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaa > 1:2276133‑M1/1‑98 (MQ=255) aGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctg > 1:3544381‑M1/1‑96 (MQ=255) ttAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaa < 1:2489485‑M1/150‑57 (MQ=255) 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ctgctACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaa > 1:691216‑M1/1‑88 (MQ=255) ctgctACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaa > 1:691215‑M1/1‑88 (MQ=255) ctgctACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaa > 1:691212‑M1/1‑88 (MQ=255) tACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggg < 1:2452167‑M1/150‑67 (MQ=255) tctTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCcttttgatttgttaaaacaccttgcggtctggcaactgcaagtgtcaaacaagaaatcaaaagggggtccc > 1:1419420‑M1/1‑79 (MQ=255) | CCCCATCGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_13/98170‑98318 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |