| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_13 | = 98318 | 0 (0.000) | 44 (0.080) | 27/218 | 1.4 | 100% | intergenic (+227/–) | gltI/– | Glutamate/aspartate import solute‑binding protein/– |
| ? | Xen14_168 | = 590 | 0 (0.000) | intergenic (‑72/–) | Xen14_04774/– | IS200/IS605 family transposase IS200C/– | |||||
CCCCATCGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_13/98170‑98318‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccggaaagctttcagctttgagccagttattaaaacccCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCC < Xen14_168/590‑520 CCCCATCGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTGGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCC < 1:1534654/150‑1 CGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAGAACCCCTTTTGA > 1:1344520/1‑150 CGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGA > 1:3429112/1‑150 GGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGAT < 1:1345925/150‑1 CCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTG > 1:2727286/1‑150 CCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTG > 1:3479379/1‑150 CCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTG > 1:735081/1‑150 CCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTG > 1:735082/1‑150 TGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTT < 1:779260/150‑1 AAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAg < 1:1453403/150‑2 AAACCGCAATGCGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAA > 1:1914399/1‑150 AAACCGCAATGCGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAA > 1:1914400/1‑150 CGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACAC < 1:367908/150‑1 CGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACAC < 1:367906/150‑1 CTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTTTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTGAAACACCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTC > 1:3547713/1‑150 GGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTG > 1:439207/1‑150 GGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTG < 1:3062892/150‑1 GGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTG > 1:1390546/1‑150 GGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGG < 1:2219939/150‑1 GTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGC < 1:1827333/150‑1 GTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGC < 1:1827340/150‑1 GTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGC < 1:1827339/150‑1 GTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGC < 1:1827338/150‑1 TAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCA > 1:855811/1‑150 CAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACT > 1:3217816/1‑150 GGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCA > 1:2128342/1‑150 GGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCA > 1:2128341/1‑150 GGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAA < 1:702517/150‑1 GGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAA < 1:702518/150‑1 TAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAAC < 1:1914104/150‑1 GCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAA > 1:2276134/1‑150 GCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAA > 1:2276133/1‑150 AGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTG > 1:3544381/1‑127 TTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAA < 1:2489485/150‑1 TAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAAT < 1:848240/150‑1 TAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAAT > 1:3707785/1‑150 TAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAAAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAAT < 1:944961/150‑1 AACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATC < 1:1923664/150‑1 ACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCA < 1:643165/150‑1 CTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAA > 1:691216/1‑150 CTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAA > 1:691215/1‑150 CTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAA > 1:691212/1‑150 TACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGG < 1:2452167/150‑1 TCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCCCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCC > 1:1419420/1‑150 CCCCATCGGGCCTGAAAACCGCAATACGCTGGGTAACAATCTTCGAGGGTAGCAGTTAACGCTGCTACCCTCTTTTTTGTGCACAGAAAACCCCCAGCTAGGCTGGGGGTTCCGGAAAGCTTTCAGCTTTGAGCCAGTTATTAAAACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_13/98170‑98318‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccggaaagctttcagctttgagccagttattaaaacccCTTTTGATTTGTTAAAACACCTTGCGGTCTGGCAACTGCAAGTGTCAAACAAGAAATCAAAAGGGGGTCCC < Xen14_168/590‑520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |