| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_105 | = 4988 | 276 (1.840) | 60 (0.510) | 35/296 | 0.7 | 17.9% | intergenic (+229/–) | Xen14_04638/– | IS3 family transposase ISCfr6/– |
| ? | Xen14_152 | 859 = | NA (NA) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
TGCCGGAAGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_105/4840‑5061 | tGCCGGAAGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTaaa < 1:2268978/150‑1 (MQ=255)tGCCGGAAGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTCATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTaaa > 1:660079/1‑150 (MQ=255) gCCGGAAGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtg < 1:2344959‑M1/150‑3 (MQ=255) gCCGGAAGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtg > 1:1744442‑M1/1‑148 (MQ=255) ccGGAAGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCATGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAgg < 1:2094731/150‑2 (MQ=255) ccGGAAGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGt > 1:3157455/1‑150 (MQ=255) aggcgcctcgcatgaaggcgtctcctcaccgATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtgaaccg > 1:3427009‑M1/16‑143 (MQ=255) aGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACgg < 1:203449/150‑1 (MQ=255) aGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACgg > 1:3620081/1‑150 (MQ=255) cgcCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtgaaccgtcc > 1:3687046‑M1/1‑140 (MQ=255) cgcCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGaa > 1:1611856/1‑150 (MQ=255) cgcCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTATCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGaa > 1:3742820/1‑150 (MQ=255) gcCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGaaa < 1:2184105/150‑1 (MQ=255) ccTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCGCAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtgaaccgccccg > 1:3236690‑M1/1‑138 (MQ=255) cTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtgaaccgccccgg > 1:41673‑M1/1‑137 (MQ=255) ttCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGATTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCg > 1:3172793/1‑150 (MQ=255) tCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtgaaccgccccgggt > 1:51220‑M1/1‑135 (MQ=255) aTGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCtg > 1:648029/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCtgt < 1:954898/150‑1 (MQ=255) tGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCtgt > 1:881568/1‑150 (MQ=255) gCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGATGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCtgtt > 1:1950523/1‑150 (MQ=255) cGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtgaaccgccccgggtttcct > 1:2125404‑M1/1‑130 (MQ=255) cGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCtgttg > 1:3445302/1‑150 (MQ=255) ggCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTgtgg < 1:908118/150‑1 (MQ=255) 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cGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTGCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTg < 1:1158935/125‑1 (MQ=255) gTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaa < 1:1566585/150‑3 (MQ=255) tACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaaca < 1:2685792/150‑5 (MQ=255) aCTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaacaa < 1:111693/150‑6 (MQ=255) ctgtcctgtcCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtgaaccgccccgggtttcctggagagtgttttatctgtgaactcaggctgccagatcatcgtttccgatggaagcataa > 1:165557‑M1/1‑71 (MQ=255) ctgtcctgtcCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAtgaaccgccccgggtttcctggagagtgttttatctgtgaactcaggctgccagatcatcgtttccgatggaag < 1:2544252‑M1/145‑75 (MQ=255) gtcctgtccGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTg > 1:1860616/1‑118 (MQ=255) gtcctgtccGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaacaataa > 1:1012842/1‑142 (MQ=255) gtcctgtccGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaacaataa < 1:1219004/150‑9 (MQ=255) ctgtccGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGTGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaacaataaagt > 1:684318/1‑139 (MQ=21) ctgtccGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaacaataaagt > 1:802858/1‑139 (MQ=255) ctgtccGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaacaataaagt > 1:2638648/1‑139 (MQ=255) ctgtccGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGCCGTAGATCAgaacaataaagt > 1:2151838/1‑139 (MQ=21) gtccGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaac < 1:1689133/140‑4 (MQ=255) gTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaacaataaag < 1:732171/141‑11 (MQ=255) gtctgGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAgaac > 1:2102097/1‑124 (MQ=255) | TGCCGGAAGCGCCTTCATGCGAGGCGTCTCCTCACCGATGCGCGTGACTCAAGAAGGGCCTGACGGTTTGTCTCGTTACTGTCCTGTCCGGGTTATCTGTCTGGAGATTCAACTCTGTTTCCTCACAGGAGCTCTGTTATGGCAGGTAAAGTTACGGAAACCGCTGTTGTGGGTGGCGTGGATACACATAAAGATCTGCACGTTGCCGCTGTCGTAGATCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_105/4840‑5061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |