| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 958 total aligned reads displayed.
ATGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAGTTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCGCGGGGTGTGCATAATACGCTTTCCCGCTACAGAGTCAAGCA‑TTTTTT‑ACTTTTCTCTGCCGGAATTCTCAGGAGAACCCCGCTGACCCGGCGGCGTGCTTGCCGTTG > Xen14_10/322‑619 | gATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAat < 1:464776‑M1/150‑3 (MQ=255) gATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCCGATAAat < 1:91256‑M1/150‑3 (MQ=255) aTCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAatt < 1:3666920‑M1/150‑4 (MQ=255) 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tctTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATTCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattattaaag < 1:1611982‑M1/150‑11 (MQ=255) ctTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCGCTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgtt < 1:149719‑M1/145‑7 (MQ=255) ctTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTNCCCACACAGATTGTCTGATAAattattaaaga > 1:1718042‑M1/1‑139 (MQ=255) ttCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagag > 1:1294923‑M1/1‑138 (MQ=255) ttCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAGTTGTTAAagag < 1:3459933/150‑1 (MQ=255) 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cTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGCCTCGGGGTGTGCATAATACGCTTTCCCGCTACAGAGTCAAGCA‑TTTTTTTGCTTTTCTCTGTTGAGATTCTCAGGAGAAc < 1:205833/126‑1 (MQ=255) gATAAATTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGCCTCTGGGTGTGCATAATACGCTTTCCCGCTACAGAGTCAAGCA‑TTTTTTTGCTTTTCTCTGTTGAGATTCTCAGGAGAACCCCGCTGACCCggcggc < 1:573743/141‑1 (MQ=255) | ATGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAGTTGTTAAAGAGCAGTGCCGCTTCGCTTTTTCTCAGCGGCGCGGGGTGTGCATAATACGCTTTCCCGCTACAGAGTCAAGCA‑TTTTTT‑ACTTTTCTCTGCCGGAATTCTCAGGAGAACCCCGCTGACCCGGCGGCGTGCTTGCCGTTG > Xen14_10/322‑619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |