| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_10 | = 471 | 559 (3.450) | 395 (3.210) | 157/268 | 0.0 | 61.0% | intergenic (–/+246) | –/hemG | –/Protoporphyrinogen IX dehydrogenase [menaquinone] |
| ? | Xen14_23 | = 73961 | 0 (0.000) | intergenic (+235/–) | gmhB/– | D‑glycero‑beta‑D‑manno‑heptose‑1,7‑bisphosphate 7‑phosphatase/– | |||||
Only 100 of 395 total aligned reads displayed.
TGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_10/323‑471‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agattgtctgataaATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAGTG < Xen14_23/73961‑73827 tcATCAAACTCTTCAACTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACATGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAA < 1:451421/148‑1TGATCACACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAA > 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CAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGT > 1:671155/1‑150 AAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAATTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTT < 1:1386663/150‑1 AAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTT > 1:2028678/1‑150 AAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTT > 1:1320725/1‑150 ACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTATTAA < 1:2329561/150‑1 ACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATCGTCTGATAAATTATTAA < 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TCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTAGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATTCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTATTAAAG < 1:1611981/150‑1 CTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGA > 1:3124924/1‑150 CTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGA > 1:3489607/1‑150 CTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGA > 1:3264356/1‑150 CTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCCTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGA < 1:462167/150‑1 CAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCA > 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AATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACT > 1:1415470/1‑150 TTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAA‑TTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTC > 1:385102/1‑150 TTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAG < 1:747164/150‑1 TTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAG > 1:1503207/1‑150 CGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGT > 1:2942422/1‑150 GTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTG > 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TGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATT > 1:896080/1‑150 TGCGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATT > 1:2086882/1‑150 CGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTT < 1:1923359/150‑1 CGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTT < 1:2952952/150‑1 CGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTT < 1:231191/150‑1 CGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTT > 1:2118889/1‑150 CGACGCTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTT < 1:2275692/150‑1 cgcTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCT > 1:2597207/4‑150 AGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCA < 1:818077/150‑1 GAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGGTAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAA < 1:515820/150‑1 CGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAA > 1:986921/1‑150 CGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGCCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAA > 1:157606/1‑150 GTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAAC > 1:2711958/1‑150 TCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGG > 1:3311641/1‑150 AGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTT < 1:641475/150‑1 CCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGT < 1:1874566/150‑1 CCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTG < 1:2801125/150‑1 cgCACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCATATACTACGCCTTCCTCTTCCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGA > 1:2885672/3‑150 CACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGA < 1:348279/150‑1 ACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAGT > 1:2717011/1‑150 CAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAGTG > 1:3608474/1‑150 TGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGATGCTCAAAGAATTAAACTTCGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > Xen14_10/323‑471‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agattgtctgataaATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCCTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTTTTCTCTTCAACCGAACCGGCTGTTTGTGTGAAGTG < Xen14_23/73961‑73827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |