| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | Xen14_1 | 1 = | 0 (0.000) | 33 (0.630) +CAAAATGAATCAATCTTTACTTTCT |
23/246 | 0.8 | 100% | intergenic (–/‑286) | –/Xen14_00001 | –/hypothetical protein |
| ? | Xen14_25 | 73164 = | NA (NA) | intergenic (‑334/–) | Xen14_02638/– | hypothetical protein/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTAAA > Xen14_1/1‑147 | aatattggcgggatgaaatagccgacgggttcacaaaaaaaccggagtccagctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTaa > 1:885628‑M1/116‑150 (MQ=255)aatattggcgggatgaaatagccgacgggttcacaaaaaaaccggagtccagctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTaa > 1:885627‑M1/116‑150 (MQ=255)aatattggcgggatgaaatagccgacgggttcacaaaaaaaccggagtccagctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTaa > 1:885624‑M1/116‑150 (MQ=255) attggcgggatgaaatagccgacgggttcacaaaaaaaccggagtccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAAtt < 1:1487554‑M1/38‑1 (MQ=255) ggcgggatgaaatagccgacgggttcacaaaaaaaccggagtccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTgg > 1:959226‑M1/110‑150 (MQ=255) ggcgggatgaaatagccgacgggttcacaaaaaaacaggagtccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTaaattcgg < 1:3724126‑M1/41‑4 (MQ=255) aaatagccgacgggttcacaaaaaaaccggagtccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCAt < 1:2687578‑M1/50‑1 (MQ=255) atagccgacgggttcacaaaaaaaccggagtccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgttaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATgg > 1:1225646‑M1/99‑150 (MQ=255) taaccgacgggttcacaaaaaaaccggagtccggctccggtttttgttgtcatgccatggtgatgtttgctaagaaagtaaagattgattcattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGa > 1:2301390‑M1/98‑150 (MQ=255) 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cattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAg > 1:363861‑M1/8‑150 (MQ=255) cattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAg > 1:363857‑M1/8‑150 (MQ=255) cattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAg > 1:285410‑M1/8‑150 (MQ=255) cattttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAg > 1:285416‑M1/8‑150 (MQ=255) cattttgAAGGTTGAAATGTATACTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAg > 1:285421‑M1/8‑150 (MQ=255) cattttgAAGGTGGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAg > 1:285407‑M1/8‑150 (MQ=255) ttttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTa < 1:1923902‑M1/145‑1 (MQ=255) ttgAAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTaaa < 1:1288166‑M1/147‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAGGTTGAAATGTATGCTATCACCATCTTCTGTAAATTTGGGGTGTTCATGGAATTCTTTAACCAGAAACCTGACTTCTCCTGACAGTCGTATTTTATCCTCTGTAAGGGATGCAGCTGCTAGCTCGGATAATGGGGCGCAAGTAAA > Xen14_1/1‑147 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |