Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_004302 11561 11719 159 2 [0] [1] 2 r1tp21 ORF21

CGATTGGAGGGGATAGATGACAATTACTGAGCAGCAATTCTATGACATGCTCAATGTTGATGAACATATGAATTTC  >  NC_004302/11712‑11787
        |                                                                   
attatttaGGGGATAGATGACAATTACTGAGCAGCAATTCTATGACATGCTCAATGTTGATGAACATATGAAttt   >  1:10981237/8‑75 (MQ=255)
 gacatttggggATAGATGACAATTACTGAGCAGCAATTCTATGACATGCTCAATGTTGATGAACATATGAATTTc  >  1:4754407/8‑75 (MQ=255)
        |                                                                   
CGATTGGAGGGGATAGATGACAATTACTGAGCAGCAATTCTATGACATGCTCAATGTTGATGAACATATGAATTTC  >  NC_004302/11712‑11787

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑