Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NODE_97	18	T→C	intergenic (–/–)	– / –	–/–

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NODE_97	18	0	T	C	85.0%	44.7 / 1.9	20	intergenic (–/–)	–/–	–/–
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (3/0);  new base C (9/8);  total (12/8)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.42e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01

GCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACTG  >  NODE_97/3‑163                |                                                                                                                                                  gCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGcccccg             >  1:3801862/1‑147 (MQ=1) gCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCAcc             >  1:2623792/1‑150 (MQ=11) gCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCAcc             >  2:786444/1‑150 (MQ=2)  cTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAACACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcg            <  2:1965234/150‑1 (MQ=11)  cTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcg            <  1:2352654/150‑1 (MQ=9)   tGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgc           >  1:1090780/1‑150 (MQ=255)   tGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgc           <  2:247980/150‑1 (MQ=255)   tGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgc           <  2:3411065/150‑1 (MQ=255)    gACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGGGCCTGCCCACcgcg          >  2:3266373/1‑150 (MQ=11)    gACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgcg          >  2:187657/1‑150 (MQ=255)      cGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTc        >  2:2601678/1‑150 (MQ=32)      cGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTc        >  2:2663185/1‑150 (MQ=255)       gTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCa       <  1:1625460/150‑1 (MQ=255)         tAACTGGCTGTGTTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGTCCCGTCTCCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCCTCaaa     >  1:2635717/1‑150 (MQ=11)          aaCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAAc    <  1:2818178/150‑1 (MQ=255)          aaCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAAc    >  2:1452642/1‑150 (MQ=255)           aCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACt   <  1:2655334/150‑1 (MQ=255)           aCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACt   <  2:2144845/150‑1 (MQ=255)           aCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACt   >  2:3157393/1‑150 (MQ=255)            cTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACTg  >  2:2286829/1‑150 (MQ=255)                |                                                                                                                                                  GCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACTG  >  NODE_97/3‑163

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑