| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NODE_9 | = 7600 | 262 (0.900) | 69 (0.890) +ATCATGCACCAATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCGGACTATTTGTAGGCACGATAAGACGCGACAGCGTCGCATCAGGCATCATGCACCA |
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| ? | NODE_9 | 7611 = | 242 (0.830) | intergenic (+88/+112) | EcoliAnna_01666/nlpE | YaeF family permuted papain‑like enzyme/envelope stress response activation lipoprotein NlpE | |||||
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
TGGGCACCTGAAGCCTGGGATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTGCAATCCTGGTTGGGGTAAA > NODE_9/7463‑7760 | gggCACCTGAAGCCTGGGATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCAtt < 1:3824603/150‑1 (MQ=255) gCACCTGAAGCCTGGGATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGc < 2:1992132/150‑1 (MQ=255) cACCTGAAGCCTGGGATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGGGCACCATTGcc > 1:602061/1‑150 (MQ=255) cTGAAGCCTGGGATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGa > 1:1012882/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTGGGATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATg > 1:3502632/1‑150 (MQ=255) ataagacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGatgccg > 1:2979473‑M2/137‑148 (MQ=255) ataagacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATgcgg < 1:738759‑M2/14‑1 (MQ=255) ataagacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATgcgg < 1:3774723‑M2/14‑1 (MQ=255) taagacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATgcggc > 2:1611837‑M2/136‑150 (MQ=255) aagacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgatgagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATgcggcg < 2:3067819‑M2/16‑1 (MQ=255) tGGGATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGt > 2:1751352/1‑150 (MQ=255) agacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGt > 2:1314710‑M2/134‑150 (MQ=255) agacgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGt > 2:4134385‑M2/134‑150 (MQ=255) ggATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTaa > 2:915756/1‑150 (MQ=255) cgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTaaa > 1:246833‑M2/131‑150 (MQ=255) cgcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTaaa > 1:1642882‑M2/131‑150 (MQ=255) gcgccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAAc < 2:3126505‑M2/21‑1 (MQ=255) aTTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAAc < 1:2211892/150‑1 (MQ=255) aTTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAAc > 2:2032659/1‑150 (MQ=255) tttATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGGGTAAACg > 2:3571371/1‑150 (MQ=255) ccagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGACGTAAACGcc < 1:4105604‑M2/24‑1 (MQ=255) cagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcctgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCt > 2:11395‑M2/126‑150 (MQ=255) agcgtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCtt < 2:2365750‑M2/26‑1 (MQ=255) 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gtcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc > 2:3409015‑M2/122‑150 (MQ=255) cAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGTCGCGCCAGCGTCGCATCAGGCATTGGGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATc > 1:1766789/1‑150 (MQ=255) tcgcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATcc < 1:1275473‑M2/30‑1 (MQ=255) gcatcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCgg < 2:695106‑M2/32‑1 (MQ=255) catcaggcatcatgcaccaattggcggatgcggcgtaaacgccttatccggtctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc < 2:1232411‑M2/33‑1 (MQ=255) catcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc < 2:3292505‑M2/33‑1 (MQ=255) cGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGcc < 2:3601582/150‑1 (MQ=255) agcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGcc < 1:923372‑M2/34‑1 (MQ=255) tcaggcatcatgcaccaattgcgggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggtccggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCt < 1:1398204‑M2/35‑1 (MQ=255) tcaggcatcatgcaccaattgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcggactatttgtaggcacgataagacgcgacagcgtcgcatcaggcatcatgcaccaATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGgcca < 2:2438647‑M2/35‑2 (MQ=255) 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tATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCgt < 2:1341643/150‑1 (MQ=255) tATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCgt > 1:3306491/1‑150 (MQ=255) aTGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCgtt < 1:1589619/150‑1 (MQ=255) tGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCgttt < 1:1075524/150‑1 (MQ=255) ggTTCTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTACACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGCCCTGTTTTGCTTTTGTTTCTg > 1:2743026/1‑150 (MQ=255) gTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGtctc > 2:2798758/1‑150 (MQ=255) tAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCa > 2:1698308/1‑150 (MQ=255) aGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCaa > 2:1909180/1‑150 (MQ=255) aGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCaa < 2:4057889/150‑1 (MQ=255) tAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGtt < 1:1991170/150‑1 (MQ=255) aGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTAc > 1:2962054/1‑150 (MQ=255) aGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTAc < 2:3870193/150‑1 (MQ=255) aCGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTg > 2:3851508/1‑150 (MQ=255) cgcgCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGc > 2:4034142/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGcc < 1:1508679/150‑1 (MQ=255) gcCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGGTACTGcccc > 2:396420/1‑150 (MQ=255) gcCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCCGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGATTGTTTCTGTCTCAACACGGGTTACTGcccc > 1:3840655/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCa > 2:417391/1‑150 (MQ=255) cGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAact < 1:2064211/150‑1 (MQ=255) gCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTg < 1:1832815/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCTCCAAACTACTGCa > 2:2666519/1‑150 (MQ=255) tCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGGAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTGCaa > 2:636857/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGTCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTGCAATc > 1:2833484/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTGCAATcc > 1:352886/1‑150 (MQ=255) gCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCATATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGGCACAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTGCAATCCt < 1:3675038/150‑1 (MQ=255) cGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTGCAATCCTg < 2:1279073/150‑1 (MQ=255) gAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTGCAATCCTGGTTg > 2:3954207/1‑150 (MQ=255) | TGGGCACCTGAAGCCTGGGATTTATATCAAGGCGGGTCGCTTTGTTGGTTTGACCCGGTGATAAAGTAAATGCCTTATCCGCCTTAAGGTATGAGGGGGGTTGTAGGCATGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGGCGTTGAGCACCATTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAAACGTGCAAATTCAAAATGTTGAAATATATCCTTCTGGCCTGTTTTGCGTTTGTTTCTGTCTCAAGACGGGTTACTGCCCCAAACTACTGCAATCCTGGTTGGGGTAAA > NODE_9/7463‑7760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |