| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NODE_7 | = 176166 | 0 (0.000) | 679 (1.320) +TTGCATCTGCTCCACGGTCAGGCCGCACG |
144/240 | 1.0 | 100% | intergenic (‑6/–) | EcoliAnna_01514/– | RHS element protein/– |
| ? | NODE_93 | = 667 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 805 total aligned reads displayed.
CTCTTCATTCAGCAGGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NODE_7/176017‑176166 | tctTCATTCAGCAGGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGCCCCTTCCGTGCTGACAAGCGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTt > 2:3265766‑M1/1‑149 (MQ=255) ttcaGCAGGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatc < 2:3794878‑M1/150‑8 (MQ=255) ttcaGCAGGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatc < 2:796034‑M1/150‑8 (MQ=255) cagcagGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctg > 1:3720349‑M1/1‑141 (MQ=255) gcagGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgct < 1:580576‑M1/150‑12 (MQ=255) agGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctcc < 2:1947741‑M1/150‑14 (MQ=255) agGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGCCCCTTCCGTGCTGACAAGCGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctcc < 1:3265766‑M1/150‑14 (MQ=255) agGTTGCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGCCCCTTCCGTGCTGACAAGCGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctcc < 1:1796190‑M1/150‑14 (MQ=255) gCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggt < 2:1448473‑M1/150‑19 (MQ=255) gCCCCATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGCCCCTTCCGTGCTGACAAGCGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccaccgt > 2:3751539‑M1/1‑132 (MQ=255) ttcatTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtca < 2:1512636‑M1/148‑21 (MQ=255) ccATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcag < 1:3635824‑M1/150‑22 (MQ=255) cATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcagg < 1:651780‑M1/150‑23 (MQ=255) cATTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGCCCCTTCCGTGCTGACAAGCGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccaccgtcagg > 2:4110406‑M1/1‑128 (MQ=255) aTTCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggc > 1:3074849‑M1/1‑127 (MQ=255) ttCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggcc < 2:1593426‑M1/150‑25 (MQ=255) ttCATCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGCCCCTTCCGTGCTGACAAGCGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccaccgtcaggcc > 2:436345‑M1/1‑126 (MQ=255) tCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcac > 1:4133910‑M1/1‑122 (MQ=255) tCGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcac < 1:3928335‑M1/150‑29 (MQ=255) cGTATTCTGCGCACCATTCTGTTGCCCCTTCCGTGCTGACAAGCGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTtttcatctgctccacggtcaggccgcacg < 1:2855388‑M1/150‑30 (MQ=255) gTATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacga > 1:1018040‑M1/1‑120 (MQ=255) gTATTCTGCGCACCATTCTGTTGCCCCTTCCGTGCTGACAAGCGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccaccgtcaggccgcacga < 1:3099211‑M1/150‑31 (MQ=255) tATTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgat < 1:2153839‑M1/150‑32 (MQ=255) aTTCTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatg > 1:2245064‑M1/1‑118 (MQ=255) cTGCTCTCCATTCTGTTGCCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgcca < 2:722400‑M1/150‑36 (MQ=255) cTGCGCACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgcca < 1:2405504‑M1/150‑36 (MQ=255) gcgcACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagc > 2:2278787‑M1/1‑113 (MQ=255) cACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccag > 2:1644362‑M1/1‑110 (MQ=255) cACCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGCCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggacaggccgcacgatgccagccag > 1:3799644‑M1/1‑110 (MQ=255) aCCATTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagc < 2:2330866‑M1/150‑42 (MQ=255) aTTCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggc < 1:2795804‑M1/150‑45 (MQ=255) ttCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcg < 2:2066711‑M1/150‑46 (MQ=255) ttCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCCCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcg < 2:1340633‑M1/150‑46 (MQ=255) tCTGTTGTCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcgg < 1:2092008‑M1/150‑47 (MQ=255) ttgtCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggcttt < 1:2531428‑M1/150‑51 (MQ=255) ttgtCCCTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggcttt < 1:1608580‑M1/150‑51 (MQ=255) cccTTCCTTGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctc < 1:3527837‑M1/150‑55 (MQ=255) tGCTGATAAGGGCCAGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcaccc > 2:64334‑M1/1‑88 (MQ=255) 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aGCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccaccgtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccagaatt > 2:2134219‑M1/1‑74 (MQ=255) gCGGCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTtttcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggattt < 1:1888945‑M1/150‑78 (MQ=255) ggCAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTtttcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcaccccgtcagccaggatttca > 2:527608‑M1/1‑71 (MQ=255) cAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTtttcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggatttcact > 2:940142‑M1/1‑69 (MQ=255) cAGGCCGCGATGGTCGCAGTGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctccctcaccccgtcagccaggatttcact > 1:1144661‑M1/1‑69 (MQ=255) 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tGGTACAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggatttcactttccagccggtcgagcatc > 1:1284409‑M1/1‑50 (MQ=255) aCAGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggatttcactttccagccggtcgagcatctgca > 2:3352426‑M1/1‑46 (MQ=255) aGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggatttcactttccagccggtcgagcatctgcacc < 2:3477181‑M1/150‑107 (MQ=255) aGGTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggatttcactttccagcccgtcgagcatctgcacc > 1:3590993‑M1/1‑44 (MQ=255) gTGGATTTTTCGCGCCGGCGTGTACACCGGGTCCATCTGGTTttgcatctgctccacggtcaggccgcacgatgccagccagcggcggctttcctcactcacccggtcagccaggatttcactttccagccggtcgagcatctgcaccag < 2:2705665‑M1/150‑109 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |