| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NODE_20 | 45,821 | Δ2 bp | intergenic (+2/‑2) | EcoliAnna_02842 → / → EcoliAnna_02843 | tRNA‑Val/tRNA‑Lys |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NODE_20 | 45,821 | 0 | T | . | 100.0% | 689.0 / NA | 162 | intergenic (+2/‑3) | EcoliAnna_02842/EcoliAnna_02843 | tRNA‑Val/tRNA‑Lys |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (70/92); total (70/92) | |||||||||||
| * | NODE_20 | 45,822 | 0 | T | . | 99.4% | 680.8 / ‑2.8 | 162 | intergenic (+3/‑2) | EcoliAnna_02842/EcoliAnna_02843 | tRNA‑Val/tRNA‑Lys |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base . (70/91); minor base G (0/1); total (70/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
GAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGG > NODE_20/45680‑45963 || gAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGtt > 1:3100727/1‑150 (MQ=255) aaGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTa < 1:2378875/150‑1 (MQ=255) gacGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGc < 2:680482/148‑1 (MQ=255) gTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTCCAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGc < 1:906965/150‑1 (MQ=255) gAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCa > 2:3142776/1‑150 (MQ=255) gTCATCCTGCCCGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCACCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGt < 2:3112695/150‑1 (MQ=255) gTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAgc > 2:2248202/1‑149 (MQ=255) tCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGtt < 2:3809614/150‑1 (MQ=255) cATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 2:299856/1‑150 (MQ=255) tCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGt < 2:2171179/150‑1 (MQ=255) tCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGt > 2:122665/1‑150 (MQ=255) ccTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTa > 2:1253015/1‑150 (MQ=255) cTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTag < 2:1990300/150‑1 (MQ=255) cTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGCTCGTTAGCTCAGTTGGTag < 1:3752452/150‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTagag < 1:4126601/150‑1 (MQ=255) gCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTagag > 1:792285/1‑150 (MQ=255) cACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 1:239240/150‑1 (MQ=255) cACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 1:3042969/150‑1 (MQ=255) gACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGt < 2:2429018/150‑1 (MQ=255) aCCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGGGTAGAATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGtt < 1:3826406/150‑1 (MQ=255) aCCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGtt < 2:3294768/150‑1 (MQ=255) cccACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTg < 1:1784607/150‑1 (MQ=255) cccACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTg < 2:1986334/150‑1 (MQ=255) cccACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTGAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTg > 1:4083949/1‑150 (MQ=255) caccacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGAc < 1:2812529/150‑1 (MQ=255) ccacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt > 1:3486700/1‑150 (MQ=255) ccacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt > 2:3359573/1‑150 (MQ=255) ccacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt < 1:3086163/150‑1 (MQ=255) ccacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt > 2:2782442/1‑150 (MQ=255) ccacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtt > 1:2368219/1‑150 (MQ=255) cacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACttt < 2:1185320/150‑1 (MQ=255) cacTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtta < 1:3317227/150‑2 (MQ=255) cacTAACATAGTTAGTTGTAGTACCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGGTCAGCTGGGAGAGCACCCCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGATCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGCCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACttt < 1:3029389/150‑1 (MQ=14) attAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtttt < 1:2164362/148‑1 (MQ=255) acTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACtttt < 1:1681352/150‑1 (MQ=255) cTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCCCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTa < 2:3234784/150‑1 (MQ=255) tAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTaa < 1:3551790/150‑1 (MQ=255) aaCATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGGTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTAAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGTCTTTTAAt > 2:367319/1‑150 (MQ=14) cATAGTTAGTTGTAGTATCCGGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCa > 2:2777776/1‑150 (MQ=255) aTAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGAGGGTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCaa > 2:899802/1‑150 (MQ=255) agttagttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAtt < 2:1132665/150‑1 (MQ=255) gttagttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTg < 2:1283503/150‑1 (MQ=255) ttagttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTgg > 2:2596912/1‑150 (MQ=255) tagttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGt < 1:4108204/150‑1 (MQ=19) agttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTc < 1:2501073/150‑1 (MQ=16) gttTTATTACCCAGCGTAGTAACGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCg < 2:4088026/150‑1 (MQ=11) ttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGGTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGGCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGc > 2:2526916/1‑150 (MQ=255) gtaTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGtt > 1:3328990/1‑150 (MQ=12) gtaTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGtt > 1:1500617/1‑150 (MQ=12) gtaTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGtt < 2:2668584/150‑1 (MQ=12) taTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTGACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTc < 1:247117/150‑1 (MQ=12) aTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCg < 2:2174781/150‑1 (MQ=12) aTCCAGCGTACTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGCCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCg < 1:2269706/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGaa > 1:2932504/1‑150 (MQ=12) gCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATcc > 2:1717085/1‑150 (MQ=12) cGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCt < 1:238962/150‑1 (MQ=12) gtagtaTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTg > 2:3635107/1‑150 (MQ=9) gtagtaTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTg > 2:2869592/1‑150 (MQ=9) tGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCg > 2:2404243/1‑150 (MQ=2) gggAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGCGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGa > 2:1936451/1‑150 (MQ=9) gggAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTGAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGa > 1:714382/1‑150 (MQ=9) ggAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGaa < 2:3056020/150‑1 (MQ=12) gagaGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAg > 2:662130/1‑150 (MQ=12) agagCCCCTCCCTTACAAGGAGGGGGCCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCGCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGa < 2:1358336/150‑1 (MQ=11) gagCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCCCGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGAc < 2:2383811/150‑1 (MQ=255) gagCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGAc > 1:1583144/1‑150 (MQ=19) aCCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGAt > 2:3198585/1‑150 (MQ=255) cTCCCTTACAAGGAGGGGGCCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGt < 1:1022966/150‑1 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTGATCACCCACCA‑‑GCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTa < 1:3947390/150‑1 (MQ=255) cccTTACAAGGAGGGGGACGGCGGTTCGATCCCGTCATCACTCAGCAC‑‑CGGGTCGTTAGCACAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTa < 2:215200/150‑1 (MQ=11) ttACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGc < 2:3129474/150‑1 (MQ=255) tACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCg < 2:1124492/150‑1 (MQ=255) aaGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCgtgt > 1:347465/1‑150 (MQ=255) ggaggGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAg < 2:2017514/150‑1 (MQ=255) ggggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATa < 1:1592393/150‑1 (MQ=255) gggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTAAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGTAGACAGATGTTAAGCGTGGAGGATag > 2:1326309/1‑149 (MQ=11) ggTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAAc > 2:569374/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCGGCTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGAGAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTAGAAACCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGGTAAGAGAGTAGGATaag > 2:2124629/1‑149 (MQ=14) tCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGt > 1:245923/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGt > 1:891161/1‑150 (MQ=255) cggcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTGCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGtt < 2:1829350/150‑1 (MQ=255) ggcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTg < 2:3101800/150‑1 (MQ=255) ggcggTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTg < 1:1817794/150‑1 (MQ=255) tCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAg < 1:439112/150‑1 (MQ=255) gATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCa > 2:411529/1‑150 (MQ=255) aTCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCaa > 1:214554/1‑150 (MQ=255) aTCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAACGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCaa < 1:3487265/150‑1 (MQ=255) tCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGCCAGCAAc < 2:4038478/150‑1 (MQ=255) ccGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACgg > 1:1077886/1‑150 (MQ=255) cGTCACCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGc < 1:167140/150‑1 (MQ=255) gTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGTCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGcc < 2:2313201/150‑1 (MQ=255) gTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGcc > 1:2414787/1‑150 (MQ=255) gTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGcc < 2:4106364/150‑1 (MQ=255) catcaCCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCg > 2:2911334/1‑150 (MQ=255) catcaCCCACCAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCg < 2:1751787/150‑1 (MQ=255) cacccaccAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAg > 1:3207721/1‑150 (MQ=255) cacccaccAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAg < 1:699315/150‑1 (MQ=255) cacccaccAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGCTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGTTGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGGAg > 2:3560802/1‑150 (MQ=14) acccaccAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAgg < 2:2853533/150‑1 (MQ=255) acccaccAC‑‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAgg < 1:1883515/150‑1 (MQ=255) || GAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGG > NODE_20/45680‑45963 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |