Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NODE_97	18	T→C	intergenic (–/–)	– / –	–/–

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NODE_97	18	0	T	C	80.0%	18.3 / ‑0.4	15	intergenic (–/–)	–/–	–/–
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (3/0);  new base C (7/5);  total (10/5)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

GCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACTG  >  NODE_97/3‑163                |                                                                                                                                                  gCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCAcc             >  1:632691/1‑150 (MQ=2) gCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGAATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCAcc             >  2:3965358/1‑150 (MQ=11)  cTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcg            <  2:2952692/150‑1 (MQ=9)   tGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGGCTGCCCACcgc           >  1:2291267/1‑150 (MQ=17)   tGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgc           <  2:3525321/150‑1 (MQ=255)   tGACGTTAACTGCTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGCGGTTATACGCGTGATGCGGCCCCTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGTCTGCGGCATCCGTCTGTGCGCTGAGACCGCCCAcccc           >  2:1243566/1‑148 (MQ=11)    gACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGGGCCTGCCCACcgcg          >  2:1964387/1‑150 (MQ=11)    gACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgcg          >  1:2944586/1‑150 (MQ=255)    gACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgcg          <  2:4123984/150‑1 (MQ=255)     aCGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGGGCCTGCCCACCGCGt         >  1:3744194/1‑150 (MQ=11)       gTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAACACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCa       <  1:1611727/150‑1 (MQ=11)       gTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCCCTGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGGGATGCGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGCGCCTGCCCACCGCGTCa       >  2:4147225/1‑150 (MQ=11)        ttAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACACCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGGGCCTGCCCACCGCGTCaa      >  2:3072472/1‑150 (MQ=17)           aCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACt   >  2:509756/1‑150 (MQ=255)            cTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACTg  <  1:4099284/150‑1 (MQ=255)                |                                                                                                                                                  GCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACTG  >  NODE_97/3‑163

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑