| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NODE_93 | 489 | 0 | T | C | 69.9% | 1282.1 / inf | 791 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (136/101); new base C (316/235); total (454/337) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 794 total aligned reads displayed.
CTGACGGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGAAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGT > NODE_93/340‑638 | cGGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCa > 1:798719/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTTTCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGGAACCGCCACCCGGGAGCt > 1:502336/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTgg > 1:3334421/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACAATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGAGTTGAAACCGCCACCGGTGGGCTgt > 1:1464923/1‑149 (MQ=255) cTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACAATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGAGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCg > 1:3685662/1‑150 (MQ=255) aCGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACAATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCACCAGAGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAAc < 1:3784507/150‑1 (MQ=255) aCGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAAc > 2:2075016/1‑150 (MQ=255) gggaaCCACAAGTGCCCTGGTACGGCTGGGACGGCGGCCGGCGGACCACAAGGCAGAGCGACAGGACCCGCAGCAAGGCGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCTCTCATCAGAGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGc < 1:3729206/147‑1 (MQ=255) aaCCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAgc < 1:1261695/150‑1 (MQ=255) aaCCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAgc > 2:2952042/1‑150 (MQ=255) cGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGCCTGACCACGATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCCGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAATCGCAGcgcc > 1:4066258/1‑150 (MQ=255) aaGTGTCCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACAATACAGAACGACAGAACCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGAGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCa < 1:2021496/150‑1 (MQ=255) aaGTGCCCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGGAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCa < 1:2089668/150‑1 (MQ=255) 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aGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTg > 1:2409839/1‑150 (MQ=255) gggTTGAAACGGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCCGGGAAGTCGGGGTCACTGTGGTGTTCCCGCCGATGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAACCCTgg > 2:1710326/1‑150 (MQ=255) gggTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTgg > 2:3815615/1‑150 (MQ=255) ggTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCAGCGGCGGAGACGGTGGCAGTGTGGTGGTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGCTGCTCGAGCCGCTGGCAAggagaaacctggg > 2:3728067/1‑138 (MQ=255) gTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt < 2:1826050/150‑1 (MQ=255) 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aaaCCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGAcc > 2:2389401/1‑150 (MQ=255) cTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTACAGCAGGCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTTCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCggg < 1:3303724/150‑1 (MQ=255) | CTGACGGGCTGGATGTCGCTGTCACGGAAACCGCAAGTGACCTGGTACGGCTGGGACGGCGACCGGCTGACCACGATACAGAACGACAGAAGCCGCATCCAGACGATTTATCAGCCGGGGAGCTTCACGCCACTCATCAGGGTCGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGT > NODE_93/340‑638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |