| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NODE_92 | 311 | 0 | G | A | 70.1% | 695.9 / inf | 559 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (80/86); new base A (191/198); total (272/287) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.25e-11 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 570 total aligned reads displayed.
GTGAACACCTGACGGTGCATCATCCGCAGACGAATGAACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCACAGGGACTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGCTGGCTGTCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCC > NODE_92/164‑460 | acacCTGACGGTGCATCATCCGCAGACGAATGAACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCACAGGGACTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGCTGGCTGTc > 1:2214275/1‑150 (MQ=255) acCTGACGGTGCATCATCCGCAGACGAATGAACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCACAGGGACTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGCTGGCTGTCAg < 1:32723/150‑1 (MQ=255) tcagACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAgg < 1:75142/147‑1 (MQ=21) gACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCAt > 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catcacCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGACAGCATGAGACCAGACATGCGTTCAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTCCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTc < 1:4014494/150‑1 (MQ=255) ccGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGac < 2:3124626/150‑1 (MQ=21) cGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGaca < 1:1499080/150‑1 (MQ=255) gCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGGGCTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGacac < 1:1701365/150‑1 (MQ=255) gCAGACGAATGAACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCACAGGGACTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGCTGGCTGTCAGGCATGAAACTCGGCGacac > 2:2786409/1‑150 (MQ=255) 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gccgTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGcc > 1:4086772/1‑150 (MQ=255) cgTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGTGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCgg > 1:217155/1‑150 (MQ=255) cgTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCgg > 1:2345798/1‑150 (MQ=255) gAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAg > 2:1821775/1‑150 (MQ=255) aaTGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGt < 2:3853542/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGACCTACGGCAGCGGCTGGCTGTCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGtt < 2:1962138/150‑1 (MQ=255) tGGCTGACCTACGGCAGCGGCTGGCTGTCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTa < 2:1421725/150‑1 (MQ=255) cTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTACag > 1:951937/1‑150 (MQ=255) tGACCTACGGCAGCGGCTGGCTGTCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTACaga > 1:1859054/1‑150 (MQ=255) cTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAGACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGATATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCCGGCAGGTACAGAGCCa > 1:1671124/1‑150 (MQ=255) 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ctggctgTCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGGACTCACCACCGCTTAAACCCCTGCCGGGCAGTTACAGAGCCAGCACCTGGACAg > 1:668498/1‑150 (MQ=255) | GTGAACACCTGACGGTGCATCATCCGCAGACGAATGAACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCACAGGGACTGGCGAACCGCTGTATACCGGACAGCCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGCTGGCTGTCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCCTGCCGGGCAGTTACAGAGCCAGCACCTGAACAGCC > NODE_92/164‑460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |