| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NODE_14 | = 77 | NA (NA) | 179 (1.070) +AGCAGTAAGCCGGTCATAAAACCGGTGGTTGTAAAAGAATTCGGTG |
96/206 | 0.7 | 100% | intergenic (–/‑68) | –/EcoliAnna_02239 | –/hypothetical protein |
| ? | NODE_35 | 1 = | 0 (0.000) | noncoding (1/76 nt) | EcoliAnna_03558 | tRNA‑Asp | |||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAGCGGTAGTTCAGTCGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCACTTATTAAGAAGCCTCGAGTTAACGCTCGAGGTTTTTTTTCGTCTGTATATCTATTATTGCCAGAATCGCAAAA > NODE_35/1‑150 | atgccgaactcagaagtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaattaagcagtaagccggtcataaaaccggtggttgtaaaagaattcggtgGAGCGGTAGTTCAGt < 1:3389149‑M2/15‑1 (MQ=255) gaactcagaagtgacacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaattaagcagtaagccggtcataaaaccggtggttgtaaaagaattcggtgGAGCGGTAGTTCAGTCGGtt < 1:1124288‑M2/20‑1 (MQ=255) gaactcagaagtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaattaagcagtaagccggtcataaaaccggtggttgtaaaagaattcggtgGAGCGGTAGTTCAGTCGGtt > 2:3579431‑M2/131‑150 (MQ=255) aactcagaagtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaattaagcagtaagccggtcataaaaccggtggttgtaaaagaattcggtgGAGCGGTAGTTCAGTCGGTTa < 1:1227537‑M2/21‑1 (MQ=255) actcagaagtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaattaagcagtaagccggtcataaaaccggtggttgtaaaagaattcggtgGAGCGGTAGTTCAGTCGGTTAg > 2:3850612‑M2/129‑150 (MQ=255) actcagaagtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaaataagcagtaagccggacataaaaccagtggttgcaaaagcattcggtgGCGCGGTAGGTCAGTCGGTTAg > 2:3267277‑M2/129‑150 (MQ=255) cagaagtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaattaagcagtaagccggtcataaaaccggtggttgtaaaagaattcggtgGAGCGGTAGTTCAGTCGGTTAGAAt > 1:3086303‑M2/126‑150 (MQ=255) cacaagtgacacgccgttgcgccgattgtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaattaagcagtaagccggtcataaaaccggtggttgtaaaagaattcggtgGAGCGGTAGTTCAGTCGGTTAGAAt < 2:2209690‑M2/25‑1 (MQ=255) agtgaaacgccgtagcgccgatggtagtgtggggtctccccatgcgagagtagggaactgccaggcatcaaattaagcagtaagccggtcataaaaccggtggttgtaaaagaattcggtgGAGCGGTAGTTCAGTCGGTTAGAATAcct > 1:955449‑M2/122‑150 (MQ=255) 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gAGCGGTAGTTCAGTCGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCACTTATTAAGAAGCCTCGAGTTAACGCTCGGGGTTTTTTTTCGTCTGTATATCTATTATTGCCAGAATCGCaaaa > 1:2021727/1‑150 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAGCGGTAGTTCAGTCGGTTAGAATACCTGCCTGTCACGCAGGGGGTCGCGGGTTCGAGTCCCGTCCGTTCCGCCACTTATTAAGAAGCCTCGAGTTAACGCTCGAGGTTTTTTTTCGTCTGTATATCTATTATTGCCAGAATCGCAAAA > NODE_35/1‑150 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |