| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NODE_18 | 86488 = | NA (NA) | 151 (1.090) +CTCTTACTTGATATGGCTTTAGTAGCGGTATCAATATCAGCAGTAAAATAAATTTCCCGA |
69/178 | 1.6 | NA | intergenic (‑280/+1) | yqaB/EcoliAnna_02742 | fructose‑1‑phosphate/6‑phosphogluconate phosphatase/tRNA‑Arg |
| ? | NODE_6 | = 77 | NA (NA) | intergenic (‑1/+3) | EcoliAnna_01179/EcoliAnna_01180 | tRNA‑Arg/tRNA‑Ser | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
AAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NODE_18/86339‑86564 | gtatcaagtaagagaTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAatat > 2:3849012/13‑150 (MQ=16) gtatcaagtaagagaTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAatat > 1:502109/13‑150 (MQ=16) atatcaattaagagaTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAata > 2:3288744/13‑150 (MQ=19) aTTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATg < 2:4008645/150‑1 (MQ=255) caattaagagaTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGt < 2:3416364/142‑1 (MQ=19) caattaagagaTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGt > 1:140908/9‑150 (MQ=19) tGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCAt > 1:1036593/1‑150 (MQ=255) tGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCAt < 1:447985/150‑1 (MQ=255) tGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCAt < 1:2923607/150‑1 (MQ=255) tGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCAt < 2:2029349/150‑1 (MQ=255) tGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCAt < 1:1777428/150‑1 (MQ=255) agaagaTGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCg < 2:2718121/150‑1 (MQ=255) gaagaTGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCgg < 2:1162994/150‑1 (MQ=255) gagaTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCg > 1:1557309/2‑150 (MQ=25) agaTGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGgga < 1:1502166/150‑1 (MQ=255) gaTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGgga < 1:3486477/150‑1 (MQ=19) aTGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGgga > 1:2802514/1‑150 (MQ=25) ggTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCGCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGAt < 2:1314834/150‑1 (MQ=255) ggTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGAt > 2:2805832/1‑150 (MQ=255) gTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGAt > 1:2835358/1‑150 (MQ=19) gTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGAt < 2:1126009/150‑1 (MQ=19) gTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGAt < 2:3547828/150‑1 (MQ=19) gTGCATCCGGGAGGATTACACGCCTTGGGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGAt < 1:97164/150‑1 (MQ=255) tGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTc < 2:3077700/150‑1 (MQ=255) 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gggAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGCTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTc > 1:1658508/1‑150 (MQ=255) actcgccttgcggctCGCCCTTCGGGCCGTAGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCt < 2:1628154/136‑1 (MQ=255) ctcgccttgcggctCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTc < 2:2900775/137‑1 (MQ=255) cAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGt > 1:3292527/1‑150 (MQ=255) gccttgcggctCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGt > 1:3156695/11‑150 (MQ=25) gccttgcggctCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGt < 2:2999086/140‑1 (MQ=25) gccttgcggctCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCgg > 1:3569921/11‑150 (MQ=37) ccttgcggctCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCACCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGtt < 2:393484/141‑1 (MQ=25) ttgcggctCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCCCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCg < 2:1881234/143‑1 (MQ=25) tgcggctCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCg > 1:915506/7‑150 (MQ=37) 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cTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCCACCGCTCCGTTCGTAGCCGAGTAc > 1:2577139/1‑150 (MQ=25) gggCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTa > 2:578283/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCCTCCCTGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATcc > 1:2366713/1‑150 (MQ=21) gCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATc < 2:4129151/150‑1 (MQ=25) ccGTTGCTAAAGCAGCGTTCTCCCCCCTGGTGCCTGCGGTTAGTACTGCCGCCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGACCCACCGACCGCGCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCa < 2:1690857/150‑1 (MQ=16) 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cctGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcaaatggcgg < 2:3752974/150‑11 (MQ=17) cctGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaa < 2:2433397/150‑10 (MQ=255) cctAGTGCCTGCGGTTACTTCCTCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGCTTTCGGAGAATATGGTGCAACCGGGAGGATTCGAACCCCCGGCCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaa < 1:1174558/150‑10 (MQ=18) cctAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaa < 2:3830045/150‑10 (MQ=21) cctAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACCGATgcatcgggaa > 1:454801/1‑141 (MQ=21) ctGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGTCCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcaaatggcggt < 1:3453505/150‑12 (MQ=17) ctGGTGCCTGCGGTTATTACCGCCACCTCTTCCATACCTTCATCGCTGAAAG‑TACGTAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcaaatggcggt > 2:2641797/1‑139 (MQ=17) tagTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaat < 2:950806/148‑12 (MQ=21) tGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaaa < 2:2664581/150‑12 (MQ=255) agTGCCTGCGGTTAATTCTGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaatt < 2:1349765/149‑13 (MQ=18) agTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaatt < 2:1945521/149‑13 (MQ=21) agTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaatt < 2:1744618/149‑13 (MQ=21) agTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaatt > 1:1020535/2‑138 (MQ=21) tGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaattta > 1:1264109/1‑136 (MQ=21) gCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaatttat < 2:1001257/150‑16 (MQ=21) gCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATgcatcgggaaatttat > 2:874850/1‑135 (MQ=21) | AAATTTTTTGGAGAAGATGGTGCATCCGGGAGGATGACTCAC‑‑TGACGTTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTGGCGCAACGTTATCCTTCCTGGTGCCTGCGGTTAATACCGCTATCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NODE_18/86339‑86564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |