Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NODE_97	18	T→C	intergenic (–/–)	– / –	–/–

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NODE_97	18	0	T	C	85.7%	28.3 / ‑3.6	14	intergenic (–/–)	–/–	–/–
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (2/0);  new base C (5/7);  total (7/7)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.62e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

GCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACT  >  NODE_97/3‑162                |                                                                                                                                                 gCTGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCAcc            <  1:3419543/150‑1 (MQ=2)   tGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgc          >  1:3151834/1‑150 (MQ=32)   tGACGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACcgc          >  2:3645348/1‑150 (MQ=255)     aCGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGGCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGGGCCCTGGGCCTGCCCGCCGCGt        >  2:258503/1‑150 (MQ=255)      cGTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAACACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTc       <  2:186376/150‑1 (MQ=11)       gTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCa      >  2:2516724/1‑150 (MQ=255)       gTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCa      >  2:799750/1‑150 (MQ=255)       gTTAACTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGACTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCa      >  1:504044/1‑150 (MQ=11)          aaCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGGTGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGTCCTGCGCCTGCCCACCGCGTCAAAc   >  2:3060909/1‑150 (MQ=11)          aaCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAAc   <  2:1865143/150‑1 (MQ=255)           aCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACt  <  1:1054397/150‑1 (MQ=255)           aCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACt  <  1:1694869/150‑1 (MQ=255)           aCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACt  <  1:2020210/150‑1 (MQ=255)           aCTGGCTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTGATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGACTGTATTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACt  <  1:779611/150‑1 (MQ=255)                |                                                                                                                                                 GCTGACGTTAACTGGTTGTGGTGGTTATAGTAAAACGCCGATGCCCTGCCATCCGGCGTGGTTATGCGCGTGATGAGGCCCGTCACCACATCCGGGCTGTACTCTGTTGTCCTGCCTGCGGCATCCGTCTGTGCCCTGAGCCTGCCCACCGCGTCAAACT  >  NODE_97/3‑162

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑