| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NODE_7 | = 176164 | 17 (0.050) | 437 (0.910) +CTTTGCATCTGCGCCACCGTCAGGCCGCACG |
158/236 | 0.2 | 98.5% | intergenic (‑4/–) | EcoliAnna_01514/– | RHS element protein/– |
| ? | NODE_93 | = 667 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 670 total aligned reads displayed.
GCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NODE_93/518‑667 | gccgcAGCCTGGCGGATGCCCTCCAGCAGTGCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCAt < 2:1141185/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCCGGGCGGATCCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGCCCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATc > 2:2641342‑M2/1‑149 (MQ=255) gccgccTGGCGGATGCGCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGAGGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgt > 1:2565030‑M2/1‑147 (MQ=255) gCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgt < 1:3575588‑M2/150‑4 (MQ=255) gCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgg < 1:3323124‑M2/150‑4 (MQ=255) gCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgt < 1:2391070‑M2/150‑4 (MQ=255) ccaGCGTGGCGGAGGCGCTTCAGCAGTCGGGCGGCGAAGACGGGGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgt > 1:2774089‑M2/2‑147 (MQ=255) cAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtg > 2:2529569‑M2/1‑146 (MQ=255) aGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgc < 1:1773192‑M2/150‑6 (MQ=255) aGCCTGGCGGATGCCCTCCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCACGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgc > 2:1874099‑M2/1‑145 (MQ=255) aGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgc < 1:3621830‑M2/150‑6 (MQ=255) cTGGCGGTTGCGCTTCAGCAGCCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggc > 1:198308‑M2/1‑142 (MQ=255) tGGCGGATGCGCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcc < 1:887125‑M2/150‑10 (MQ=255) tGGCGGATCCCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcc > 2:46713‑M2/1‑141 (MQ=255) ggCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcct < 1:3102502‑M2/150‑11 (MQ=255) ggCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcct < 2:3229455‑M2/150‑11 (MQ=255) gCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctg < 1:3893335‑M2/150‑12 (MQ=255) cGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgg < 2:3836206‑M2/150‑13 (MQ=255) gATGCGCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGATGAGAGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacc < 1:1615450‑M2/150‑15 (MQ=255) aTGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccg < 1:1836159‑M2/150‑16 (MQ=255) aTACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacgg < 2:1703057‑M2/150‑16 (MQ=255) tacccttCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGTGAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacggt < 2:2781818‑M2/148‑17 (MQ=255) cccctTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCGGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacggtg > 1:841139‑M2/2‑133 (MQ=255) cTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggag < 1:26795‑M2/150‑21 (MQ=255) ttCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacggtggagc > 1:3445548‑M2/1‑129 (MQ=255) tCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAACGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGCGAGGAAAGACGCCGCGGGCTGGGATcgtgggccctggccgtggtgca < 2:2425582‑M2/150‑23 (MQ=255) ccagcagcCCGGCGGCGAAGCGGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGGGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagca > 1:2243932‑M2/2‑128 (MQ=255) agcagTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacggtggcgcaga < 1:3398929‑M2/150‑25 (MQ=255) gcagTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCGGGTGCTGGTGCAGATGCACGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacggtggcgcagat > 2:686912‑M2/1‑125 (MQ=255) gcagTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagat < 1:484028‑M2/150‑26 (MQ=255) cagTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatg > 1:1073367‑M2/1‑124 (MQ=255) agTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGCCTGACCGGGTGAGTGAGGAAACCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatgc > 2:2974382‑M2/1‑123 (MQ=255) ccGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatgcaaa < 1:1010067‑M2/150‑31 (MQ=255) ggggggcgAAGAGGGTGGCTGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatgcaaaa > 2:4069408‑M2/2‑119 (MQ=255) ggcggcGAAGACGGTGGCGGTGTGGTGTCCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatgcaaaac > 1:2493253‑M2/1‑118 (MQ=255) ggcggcGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcaggtgcaaaac < 1:1736385‑M2/150‑33 (MQ=255) ggcggcGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatgcaaaac < 1:3244469‑M2/150‑33 (MQ=255) ggcggcGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatgcaaaac < 1:377130‑M2/150‑33 (MQ=255) 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aggaAAGTGAAATCCTGGCTGACGGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacggtggcgcagatgcaaagccagatggacccggtatacacgccggcgcgaaaaattcacctgtaccactgcgaccatcgcg > 2:347925‑M2/2‑57 (MQ=255) tGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacggtggcgcagatgcaaagccagatggacccggtatacacgccggcgcgaaaaattcacctgtaccactgcgaccatcgcggcctgccgctggcccttat > 1:2933905‑M2/1‑38 (MQ=255) agtgagGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatgcaaaaccagatggacccggtgtacacgccggcgcgaaaaatccacctgtaccactgcgaccatcgcggcctgccgctggcccttatcagcaaggaa < 2:3682458‑M2/150‑123 (MQ=255) tgagGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgacggtggcgcagatgcaaagccagatggacccggtatacacgccggcgcgaaaaattcacctgtaccactgcgaccatcgcggcctgccgctggcccttatcagcacggaagg < 1:3993499‑M2/150‑125 (MQ=255) gagGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATcgtgcggcctgaccgtggagcagatgcaaaaccagatggacccggtgtacacgccggcgcgaaaaatccacctgtaccactgcgaccatcgcggcctgccgctggcccttatcagcaaggaaggg > 2:2118511‑M2/1‑25 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |