| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NODE_1 | 74136 = | 194 (0.950) | 97 (0.500) +TTGGGTGGTCTGTGCCTTACAGCACTTTCAAAT |
63/232 | 3.7 | 38.6% | noncoding (1/76 nt) | EcoliAnna_00080 | tRNA‑Gly |
| ? | NODE_17 | = 189 | 203 (0.680) | intergenic (+2/+268) | EcoliAnna_02550/queG | tRNA‑Gly/tRNA epoxyqueuosine(34) reductase QueG | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TTTCGGCGTAATTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAGTTTAAAAGACATCGGCGTCAAGCGGATGTCTGGCTGAAAGGCCTGAAGAATTTGGCGCGTTAACAAAGCGGTT > NODE_1/73988‑74285 | tCGGCGTAATTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATgggg > 2:154969/1‑150 (MQ=255) tCGGCGTAATTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCgg < 1:599450/150‑1 (MQ=255) cGGCGTAATTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCggg < 2:3018817/150‑1 (MQ=255) gCGTAATTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGaa > 1:3704309/1‑150 (MQ=255) gTAATTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGTCAGACGATAATACAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATa > 1:1625183/1‑150 (MQ=255) gTAATTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATa < 2:4084471/150‑1 (MQ=255) gTAATTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATa > 2:3160359/1‑150 (MQ=255) aaTTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGc < 1:3081966/150‑1 (MQ=255) aTTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGGTGAATGCGGGAAAAGCt > 1:359736/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCt < 1:2632312/150‑1 (MQ=255) aTTTTCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCt > 1:236967/1‑150 (MQ=255) ttttCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTc < 1:94899/150‑1 (MQ=255) ttttCAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTc < 2:1780493/150‑1 (MQ=255) cAGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGTTGAATGCGGGAATAGCTCAGtt > 2:3568066/1‑150 (MQ=255) aGCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTg > 1:2077520/1‑150 (MQ=255) gCAAACGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTgg < 2:1293031/150‑1 (MQ=255) cGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAGTAGCTCAGTTGGTagag > 2:1659274/1‑150 (MQ=255) cGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTagag < 2:3818392/150‑1 (MQ=255) cGATCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGGagag > 1:871537/1‑150 (MQ=255) aTCAAAAGTGCTCAAAAATATCGTTGACTCATCGCTCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCCCAGTTGGTAGAGCa < 2:248898/150‑1 (MQ=255) tCAAAAGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAc < 2:3902970/150‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAc > 1:2824491/1‑150 (MQ=255) gtggtgAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCtt < 2:947860/150‑1 (MQ=255) tggtgAAAAATATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTg > 2:4049117/1‑150 (MQ=255) aaaaaTATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAg < 1:1716192/150‑1 (MQ=255) aaaTATCGTTGACACATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGt < 1:63416/150‑1 (MQ=255) aaTATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTc > 1:3329613/1‑150 (MQ=255) aaTATCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTc < 2:1141511/150‑1 (MQ=255) tatCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCgg > 1:4081147/1‑150 (MQ=255) tatCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCgg > 2:188236/1‑150 (MQ=255) tCGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCgggg > 2:1934663/1‑150 (MQ=255) cGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGt < 2:419770/150‑1 (MQ=255) cGTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGt < 1:139318/150‑1 (MQ=255) gTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTc > 2:3902835/1‑150 (MQ=255) gTTGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTc < 2:1269944/150‑1 (MQ=255) tGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgc > 1:3435058/1‑150 (MQ=255) tGACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGACGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgc > 2:2093666/1‑150 (MQ=255) gACTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgcg > 1:3191298/1‑150 (MQ=255) tcTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGCTGAATGCGGGTCTAGCTCAGTTGGTTGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgcgt > 2:273229/2‑149 (MQ=255) aCTCATCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGa > 2:2203109/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGGGAGTTc > 2:1126528/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTc > 2:3970333/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCCAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTc > 1:1000016/1‑150 (MQ=255) 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cAGGTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAAtctc < 1:1126528/150‑1 (MQ=255) gTAAGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGtt < 2:2457404/150‑1 (MQ=255) aaGTAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTc > 2:3148116/1‑150 (MQ=255) gTAGAATGCATCGCATCGAACGGCGGCACTGATGGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCGAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTccc < 2:805083/150‑1 (MQ=255) tAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCg < 2:3410628/150‑1 (MQ=255) tAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCg < 1:3972907/150‑1 (MQ=255) tAGAATGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCg > 1:3674311/1‑150 (MQ=255) aaTGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTc > 1:3118385/1‑150 (MQ=255) aTGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTcc > 1:3073538/1‑150 (MQ=255) aTGCAACGCATCGAACGGCGGCACTGATTGCCAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTcc < 1:2520385/150‑1 (MQ=255) 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ccAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCGCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGGCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCGCGCTCCAGTTTAAAAGACATCGGCGTCAAGCGGATg < 1:3877648/150‑1 (MQ=255) cAGACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAGTTTAAAAGACATCGGCGTCAAGCGGATGt > 2:1084484/1‑150 (MQ=255) gACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAGTTTAAAAGACATCGGCGTCAAGCGGATGTCt > 1:1976266/1‑150 (MQ=255) gACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAGTTTAAAAGACATCGGCGTCAAGCGGATGTCt < 1:425942/150‑1 (MQ=255) cGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTTGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAGTTTAAAAGACATCGGCGTCAAGCGGATGTCTgg > 2:369645/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |