| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NODE_20 | 45,821 | Δ2 bp | intergenic (+2/‑2) | EcoliAnna_02842 → / → EcoliAnna_02843 | tRNA‑Val/tRNA‑Lys |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NODE_20 | 45,822 | 0 | T | . | 100.0% | 627.0 / NA | 150 | intergenic (+3/‑2) | EcoliAnna_02842/EcoliAnna_02843 | tRNA‑Val/tRNA‑Lys |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base . (67/83); total (67/83) | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGG > NODE_20/45679‑45963 || cGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGt < 1:2793114/150‑1 (MQ=255)cGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGGTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGt > 2:1322304/1‑150 (MQ=255) aaGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑‑CGGGTCGTTa > 2:3664116/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |