| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,114,113 | 2 bp→AT | coding (291‑292/405 nt) | SAUSA300_RS10725 ← | Holliday junction DNA helicase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,114,113 | 0 | G | A | 100.0% | 43.6 / NA | 16 | L98L (CTA→TTA) | SAUSA300_RS10725 | Holliday junction DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (3/13); total (3/13) | |||||||||||
| * | NC_007793 | 2,114,114 | 0 | A | T | 100.0% | 41.4 / NA | 16 | V97V (GTT→GTA) | SAUSA300_RS10725 | Holliday junction DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (3/13); total (3/13) | |||||||||||
GCTTTGAGCTAGTTATTTCTGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCACAAATAATTGTTACAAGCGTCTAGAACTGTCTTCATCAAATTATCGATATCTGGTTTAGTTACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGTTTTCTTTTTCTTCGACCATGATTT > NC_007793/2114047‑2114200 || gatctgggCTAGTTATTTCTGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCATACATGGCCATTACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGctt < 1:5668041/93‑1 (MQ=255) ttGAGCTAGTTATTTCTGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCATACATGGCCATTACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCggctcaga > 1:1749587/1‑94 (MQ=255) ttGAGCTAGTTATTTCTGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCATACATGGCCATTACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCggccagta < 1:707091/100‑7 (MQ=255) aGTTATTTCTGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCATACATGGCCATTACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACtttt > 1:1250598/1‑100 (MQ=255) cTGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCATACATGGCCATTACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTcc < 1:2261277/100‑1 (MQ=255) tGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCATACATGGCCATTACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCa < 1:2027841/100‑1 (MQ=255) tGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCATACATGGCCATTACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCa < 1:2618373/100‑1 (MQ=255) gTAATTTGGTTATCGTCTTTCCATACATGGCCATTACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCaa > 1:4603679/1‑100 (MQ=255) acatggccattACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGCTTTCTTTTTCTTCg < 1:5410190/91‑1 (MQ=255) tACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGCTTTCTTTTTCTTCGACCATGAttc < 1:1165483/100‑2 (MQ=255) tACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGCTTTCTTTTTCTTCGACCATGAttc < 1:1778348/100‑2 (MQ=255) tACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGCTTTCTTTTTCTTCGACCATGAttc < 1:272842/100‑2 (MQ=255) tACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGCTTTCTTTTTCTTCGACCATGAttc < 1:4125963/100‑2 (MQ=255) tACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGCTTTCTTTTTCTTCGACCATGAttc < 1:4263033/100‑2 (MQ=255) tACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGCTTTCTTTTTCTTCGACCATGAttc < 1:4299599/100‑2 (MQ=255) tACAAGCATCTAATACCGTTTTAATTAAGTTGTCGATATCCGGCTTAGTCACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGCTTTCTTTTTCTTCGACCATGAttc < 1:5475324/100‑2 (MQ=255) || GCTTTGAGCTAGTTATTTCTGTAATTTGGTTATCGTCTTTCCACAAATAATTGTTACAAGCGTCTAGAACTGTCTTCATCAAATTATCGATATCTGGTTTAGTTACTTTTAATTGTCCAATCGCTTGAGTTTTCTTTTTCTTCGACCATGATTT > NC_007793/2114047‑2114200 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |