| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,698,243 | T→C | Y568H (TAT→CAT) | SAUSA300_RS13855 → | copper‑exporting P‑type ATPase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,698,243 | 0 | T | C | 99.4% | 1431.3 / ‑4.3 | 527 | Y568H (TAT→CAT) | SAUSA300_RS13855 | copper‑exporting P‑type ATPase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/0); new base C (522/1); total (526/1) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 527 total aligned reads displayed.
TTATGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACTATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAACACATTATGAACGAGATGGTA > NC_007793/2698152‑2698339 | tcaTGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATAttg > 1:5773121/3‑100 (MQ=255) tATGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATAttgg > 1:2126222/1‑100 (MQ=255) taaaggCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAAcc > 1:41696/2‑100 (MQ=255) gctAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCt > 1:131190/3‑100 (MQ=255) tAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGa > 1:2738256/1‑100 (MQ=255) tAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGa > 1:202028/1‑100 (MQ=255) tAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGa > 1:513765/1‑100 (MQ=255) atGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACaa > 1:1291622/2‑100 (MQ=255) gagaCAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATg > 1:1087030/1‑100 (MQ=255) gagaCAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATg > 1:1706846/1‑100 (MQ=255) gagaCAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATg > 1:736535/1‑100 (MQ=255) agaCAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCGCCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGa > 1:637954/1‑100 (MQ=255) aacaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATAtt > 1:5230150/1‑100 (MQ=255) acaacaTTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTa > 1:4186029/1‑100 (MQ=255) ttAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGcc > 1:382915/1‑100 (MQ=255) tAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCt > 1:2827680/1‑100 (MQ=255) aggCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTaa > 1:4130867/3‑100 (MQ=255) tcAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGc > 1:1371713/2‑100 (MQ=255) cAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCa > 1:1561380/1‑100 (MQ=255) cAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCa > 1:885247/1‑100 (MQ=255) aGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCat > 1:5652456/1‑100 (MQ=255) aGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCat > 1:4529647/1‑100 (MQ=255) aGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCat > 1:3378185/1‑100 (MQ=255) gTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCata > 1:3069082/1‑100 (MQ=255) gacTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAtt > 1:935768/3‑100 (MQ=255) ctcTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAtt > 1:2406578/3‑100 (MQ=255) aCCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAtt > 1:3313205/1‑100 (MQ=255) aCCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAtt > 1:2371141/1‑100 (MQ=255) aCCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAtt > 1:3558935/1‑100 (MQ=255) ccTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:4927935/1‑100 (MQ=255) ccTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:2441695/1‑100 (MQ=255) ccTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATAttt > 1:4448515/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:1874129/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:4661591/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:4621102/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:1586522/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:2574815/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:25519/1‑100 (MQ=255) cTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTc > 1:4225445/1‑100 (MQ=255) tGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCt > 1:3110360/1‑100 (MQ=255) tGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCt > 1:3409733/1‑100 (MQ=255) tGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCt > 1:2228598/1‑100 (MQ=255) tGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCt > 1:2202595/1‑100 (MQ=255) tGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCt > 1:4288711/1‑100 (MQ=255) tGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCt > 1:4383505/1‑100 (MQ=255) ggacATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5583238/4‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCCCCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2325240/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCATCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTTGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5638566/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGTTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:487301/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:102843/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5473079/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2276141/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:899248/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1117875/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1158598/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1201330/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:591995/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4722094/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4809248/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1250752/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5006913/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5705970/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5079217/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1465084/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5330851/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5387670/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:14037/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2916752/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2087330/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3194528/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:300264/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1932575/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3471792/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3614587/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3682237/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3766003/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:294199/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3793904/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3891267/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:3975663/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4023883/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4100423/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:2651383/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1793882/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:1633416/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4367316/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATACTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:5558824/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGCTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:405221/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATAGATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4070363/1‑100 (MQ=255) ggCCATGGTATTGAAGCAAAGATTGATCATCACCATCTATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4771254/1‑100 (MQ=255) ggCCATAGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCtg > 1:4306034/1‑100 (MQ=255) tGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTgatgat > 1:3272458/1‑100 (MQ=255) ggTATTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGAtt > 1:2501638/1‑100 (MQ=255) aTTGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTaa > 1:2770193/1‑100 (MQ=255) tGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAaca > 1:5747779/1‑100 (MQ=255) tGAAGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAaca > 1:1494621/1‑100 (MQ=255) aaGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAAcaca > 1:1839324/1‑100 (MQ=255) aaGCAACGATTGATCATCACCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAAcaca > 1:2344468/1‑100 (MQ=255) tcaCCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAACACATTATGAACGAGATGGt > 1:808060/1‑100 (MQ=255) caCCATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAACACATTATGAACGAGATGGTa > 1:5051023/1‑100 (MQ=255) | TTATGCAAAAGAAAAGCAATTAATATTAACTGAGACAACAACATTTAAAGCAGTACCTGGCCATGGTATTGAAGCAACGATTGATCATCACTATATATTGGTTGGTAACCGTAAATTAATGGCTGACAATGATATTAGCTTGCCTAAGCATATTTCTGATGATTTAACACATTATGAACGAGATGGTA > NC_007793/2698152‑2698339 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |