Predicted mutation
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*	NC_007793	2,486,782	0	C	T	98.9%	242.1 / ‑5.4	88	V244I (GTA→ATA)	SAUSA300_RS12780	L‑lactate permease
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/1);  new base T (4/83);  total (4/84)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01

AAATGTGTTTTGGTTGGAATTTTTTAGAAAATACTGCTAATGCTAACATTGTTAATAACGGTGGAATAATATCTGCTAATTCAGGTCCACTGAATACAGTTAATAATCCTTGAGTAAATGTATAAGTGATTGAAACTACTAAAATTGCTGGTAATGTTTCTTTAACACCTCTAAAACCATCAATAAT  >  NC_007793/2486686‑2486872                                                                                                 |                                                                                           agaTGTGTTTTGGTTGGAATTTTTTAGAAAATACTGCTAATGCTAACATTGTTAATAACGGTGGAATAATATCTGCTAATTCAGGTCCACTGAATATAGt                                                                                         >  1:3154116/3‑100 (MQ=255)   aTGTGTTTTGGTTGGAATTTTTTAGAAAATACTGCTAATGCTAACATTGTTAATAACGGTGGAATAATATCTGCTAATTCAGGTCCACTGAATATAGTta                                                                                       >  1:5081073/1‑100 (MQ=255) 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                                                                                  aGGTCCACTGAATATAGTTAATAATCCTTGAGTAAGTGTATAAGTGATTGAAACTACTAAAATTGCTGGTAATGTTTCTTTAACACCTCTAAAACCATCa       <  1:2210635/100‑1 (MQ=255)                                                                                   aGGTCCACTGAATATAGTTAATAATCCTTGAGTAAGTGTATAAGTGATTGAAACTACTAAAATTGCTGGTAATGTTTCTTTAACACCTCTAAAACCATCa       <  1:1725003/100‑1 (MQ=255)                                                                                   aGGTCCACTGAATATAGTTAATAATCCTTGAGTAAGTGTATAAGTGATTGAAACTACTAAAATTGCTGGTAATGTTTCTTTAACACCTCTAAAACCATCa       <  1:1187042/100‑1 (MQ=255)                                                                                   aGGTCCACTGAATATAGTTAATAATCCTTGAGTAAGTGGATAAGTGATTGAAACTACTAAAATTGCTGGTAATGTTTCTTTAACACCTCTAAAACCATCa       <  1:5786807/100‑1 (MQ=255)                                                                                     gTCCACTGAATATAGTTAATAATCCTTGAGTAAGTGTATAAGTGATTGAAACTACTAAAATTGCTGGTAATGTTTCTTTAACACCTCTAAAACCATCaag     <  1:5384558/100‑2 (MQ=255)                                                                                        cACTGAATATAGTTAATAATCCTTGAGTAAGTGTATAAGTGATTGAAACTACTAAAATTGCTGGTAATGTTTCTTTAACACCTCTAAAACCATCaataat  >  1:1085493/1‑100 (MQ=255)                                                                                                 |                                                                                           AAATGTGTTTTGGTTGGAATTTTTTAGAAAATACTGCTAATGCTAACATTGTTAATAACGGTGGAATAATATCTGCTAATTCAGGTCCACTGAATACAGTTAATAATCCTTGAGTAAATGTATAAGTGATTGAAACTACTAAAATTGCTGGTAATGTTTCTTTAACACCTCTAAAACCATCAATAAT  >  NC_007793/2486686‑2486872

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑