| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,445,965 | G→A | intergenic (‑474/+13) | SAUSA300_RS12570 ← / ← SAUSA300_RS12575 | membrane protein/oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,445,965 | 0 | G | A | 100.0% | 18.0 / NA | 8 | intergenic (‑474/+13) | SAUSA300_RS12570/SAUSA300_RS12575 | membrane protein/oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (3/5); total (3/5) | |||||||||||
ACACACCTTTACCGACTATTTAAAATACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAGCTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCTAACACCGAACACTTGTCCGGTTGTATAACTTGATTCTTCTGACGCTAATAGCACATAAG > NC_007793/2445869‑2446060 | acacacCTTTACCGACTATTTAAAATACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACtt > 1:3983905/1‑100 (MQ=255) cacacCTTTACCGACTATTTAAAATACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTc > 1:4405285/1‑100 (MQ=255) aaaTACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGc < 1:1878075/100‑1 (MQ=255) aaTACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCa < 1:1752787/100‑1 (MQ=255) aCCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCt < 1:3103268/100‑1 (MQ=255) gatcttctctttaatttaaTGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCTa < 1:5071957/91‑1 (MQ=255) tCAATTAAAAACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCTAACACCGAACACTTGTCCGGTTGTATAACTTGATTCTTCTGACGCTAATAGca < 1:3782175/100‑1 (MQ=255) aaaaACTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCTAACACCGAACACTTGTCCGGTTGTATAACTTGATTCTTCTGACGCTAATAGCACATAAg > 1:2211427/1‑100 (MQ=255) | ACACACCTTTACCGACTATTTAAAATACACTTCACCAATTCATTTTAATTTAATGGATTGAAGTAACTAAATTAATATTATGTTGTTCAATTAAAAGCTTCATACAAACCTAATCTATTTGCACTCCACCGCTAACACCGAACACTTGTCCGGTTGTATAACTTGATTCTTCTGACGCTAATAGCACATAAG > NC_007793/2445869‑2446060 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |