| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,202,205 | T→C | K187K (AAA→AAG) | SAUSA300_RS11210 ← | DEAD/DEAH box family ATP‑dependent RNA helicase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,202,205 | 0 | T | C | 99.7% | 3331.7 / ‑5.0 | 1146 | K187K (AAA→AAG) | SAUSA300_RS11210 | DEAD/DEAH box family ATP‑dependent RNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/4); new base C (9/1133); total (9/1137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.42e-01 | |||||||||||
Only 100 of 1151 total aligned reads displayed.
TATAGAATTCTTCGATTTGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCTTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAATTTTATCCATAATAAATCTCATATCATCGATGAATCCCATATTCATC > NC_007793/2202108‑2202301 | tataGAATTCTTCGATTTGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCctt < 1:4639255/100‑1 (MQ=255) aGAATTCTTCGATTTGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAgg < 1:4546194/100‑1 (MQ=255) aGAATTCTTCGATTTGTGGATCAGACATTTCATTACTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAgg < 1:2067436/100‑1 (MQ=255) ctcttccGATCTGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCAt < 1:81998/94‑1 (MQ=255) ttcttcGATTTGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCAtt < 1:4751607/100‑1 (MQ=255) ttccGATCTGTTGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCCTTGt < 1:5639843/97‑1 (MQ=255) ttccGATCTGTGGTTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAAAGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:4203992/97‑1 (MQ=255) ttccGATCTGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:3810165/97‑1 (MQ=255) ttccGATCTGTGGATCAGACATTTCATTATTCATCGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:2401206/97‑1 (MQ=255) ttccGATCTGTGGACCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:1867178/97‑1 (MQ=255) ttccGATCTGTGCGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:2322145/97‑1 (MQ=255) ttccGATCTGTGCATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:5232317/97‑1 (MQ=255) tccggtcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGGTTGCCTTAGGCATTGt < 1:2983364/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGTATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:1260630/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGTTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:5015014/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGTTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:2644459/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGTTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:2597579/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTga < 1:3876546/93‑2 (MQ=255) tccgatcttGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:2931223/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:1751783/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:2513749/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:873865/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGGTCAGACATATCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTAATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:3496902/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGCTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:4963400/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:5190658/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:1000609/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:4486571/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:1642411/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:743015/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:1530833/93‑1 (MQ=255) tccgatcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGGTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:3930669/93‑1 (MQ=255) cttcGATTTGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:487469/100‑1 (MQ=255) cttcGATCTGTGGACCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:4797384/100‑1 (MQ=255) ccgatctttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGt < 1:2702727/94‑1 (MQ=255) tccGATCTGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTa < 1:3042877/98‑1 (MQ=255) cgatcttGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAg < 1:245922/95‑1 (MQ=255) atcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAggc < 1:283549/97‑3 (MQ=255) tcttGTGGTTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTg < 1:3086566/98‑1 (MQ=255) tcttGTGGGTCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTg < 1:266880/98‑1 (MQ=255) tcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTg < 1:1059976/98‑1 (MQ=255) tcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTg < 1:1178543/98‑1 (MQ=255) tcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTg < 1:1321334/98‑1 (MQ=255) tcttGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTg < 1:608919/98‑1 (MQ=255) tcgtgtgGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTg < 1:3380128/97‑1 (MQ=255) atctgtgGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTg < 1:1216793/97‑1 (MQ=255) tgtgGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTgaga < 1:367041/100‑1 (MQ=255) attCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGt < 1:1419427/100‑1 (MQ=255) attCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGt < 1:1463928/100‑1 (MQ=255) cATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTAct < 1:4168121/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgc < 1:4305844/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTAcagc < 1:3139654/100‑1 (MQ=255) tGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgct < 1:5454017/100‑1 (MQ=255) tGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgct < 1:3319606/100‑1 (MQ=255) tGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgcc < 1:4423418/100‑2 (MQ=255) tGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATGGTTTGACGTTGTActgct < 1:5425966/100‑1 (MQ=255) tGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATCGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgct < 1:5599872/100‑1 (MQ=255) tGTCTTAATGATTTTTGGTGATTCCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgct < 1:2274867/100‑1 (MQ=255) gTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgctg < 1:5062588/100‑1 (MQ=255) tcttgttGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:3257221/94‑1 (MQ=255) tCTTAGTGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:3531290/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCTTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:1137446/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgctgc < 1:2773078/100‑2 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgctga < 1:3593458/100‑2 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:2004525/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:2211182/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:51282/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:2543366/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:2183081/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:5329306/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:4909465/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:5373222/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:5391667/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:1813148/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:5711014/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:5749826/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:1687127/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:65375/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:1378891/100‑1 (MQ=255) tCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:92439/100‑1 (MQ=255) gcTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATGGTTGTCCTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgg < 1:5287808/99‑1 (MQ=255) cTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgctgag < 1:4003704/100‑3 (MQ=255) cTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTActgctgag < 1:3752679/100‑3 (MQ=255) cTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTggt < 1:4064168/100‑2 (MQ=255) cTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTggt < 1:158639/100‑2 (MQ=255) cTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTggt < 1:3718426/100‑2 (MQ=255) cTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTggg < 1:4825371/100‑2 (MQ=255) cTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGa < 1:426668/100‑1 (MQ=255) cTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGa < 1:4360872/100‑1 (MQ=255) ttAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTgggc < 1:344839/100‑3 (MQ=255) ttAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGag < 1:5533204/100‑2 (MQ=255) ttAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGag < 1:4592949/100‑2 (MQ=255) ttAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGaa < 1:3409975/100‑1 (MQ=255) tAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAAt < 1:4717228/100‑1 (MQ=255) tGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAAtttt < 1:2118187/100‑1 (MQ=255) aatGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAATTTTATCCa > 1:712492/3‑100 (MQ=255) ggTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAATTTTATCCataa > 1:1508487/1‑100 (MQ=255) tAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAATTTTATCCATAATAAATCTCat < 1:1959203/100‑1 (MQ=255) tgttgtACTAAAGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAATTTTATCCATAATAAATCTCATatcag < 1:5481031/100‑2 (MQ=255) aGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAATTTTATCCATAATAAATCTCATATCATCGATGAATccc < 1:3219371/100‑1 (MQ=255) aGCTTGGATTGCCTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAATTTTATCCATAATAAATCTCATATCATCGATGAATccc < 1:2878990/100‑1 (MQ=255) | TATAGAATTCTTCGATTTGTGGATCAGACATTTCATTATTCATTGTCTTAATGATTTTTGGTGATTTCATAAATTGTTGTACTAAAGCTTGGATTGCTTTAGGCATTGTAGCTGAGAACAACATTGTTTGACGTTGTACTGCTGGAATTTTATCCATAATAAATCTCATATCATCGATGAATCCCATATTCATC > NC_007793/2202108‑2202301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |