| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,120,965 | A→G | H15H (CAT→CAC) | SAUSA300_RS10775 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,120,965 | 0 | A | G | 100.0% | 35.4 / NA | 15 | H15H (CAT→CAC) | SAUSA300_RS10775 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (2/13); total (2/13) | |||||||||||
GATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCACTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAATAACCAATTAGCTCATCATATTCATCTTTTGTGATAAGTACATGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATGTGTGGCATTTCTATCTTTCCTTTCGTGTATAATGTTGTTATCTCCTAGTGAA > NC_007793/2120867‑2121053 | gATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGcacac < 1:1688688/100‑2 (MQ=255) cAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACgtgtgt < 1:5038316/100‑1 (MQ=255) tttttAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTc < 1:2955525/100‑1 (MQ=255) tcttTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTggcat < 1:2564429/100‑4 (MQ=255) tttAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATGAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACta < 1:5756938/100‑2 (MQ=255) ccATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAAtatgt > 1:1772198/1‑100 (MQ=255) aagaaCAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTCTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAAtatgt > 1:2540833/5‑100 (MQ=255) tctggggTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGc < 1:4142774/96‑1 (MQ=255) tACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGc < 1:5032441/100‑1 (MQ=255) tACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTCCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGc < 1:4082272/100‑1 (MQ=255) ctgggTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTgggca < 1:4909544/98‑4 (MQ=255) aGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGCAtt < 1:1870316/100‑1 (MQ=255) aTGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGCATTTCTATctt < 1:1516677/100‑1 (MQ=255) catATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGCATTTCTATCTTTCCTTTCGTGTATAAtgttgt < 1:2169587/100‑1 (MQ=255) atcttCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGCATTTCTATCTTTCCTTTCGTGTATAATgttgtt < 1:362871/97‑1 (MQ=255) gtgATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGCATTTCTATCTTTCCTTTCGTGTATAATGTTGTTAtcaacctaaagt < 1:2093567/100‑11 (MQ=37) gtgATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGCATTTCTATCTTTCCTTTCGTGTATAATGTTGTTAtcaacctaaagt < 1:1703063/100‑11 (MQ=37) | GATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCACTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAATAACCAATTAGCTCATCATATTCATCTTTTGTGATAAGTACATGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATGTGTGGCATTTCTATCTTTCCTTTCGTGTATAATGTTGTTATCTCCTAGTGAA > NC_007793/2120867‑2121053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |