| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,120,923 | A→G | Y29Y (TAT→TAC) | SAUSA300_RS10775 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,120,923 | 0 | A | G | 100.0% | 47.0 / NA | 19 | Y29Y (TAT→TAC) | SAUSA300_RS10775 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (2/17); total (2/17) | |||||||||||
CTAGGATGAAATAGTAATCTGTCCTTGATAGTCTCATCAGATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCACTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAATAACCAATTAGCTCATCATATTCATCTTTTGTGATAAGTACATGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATGTGTGGCATTTCTATCTT > NC_007793/2120828‑2121018 | cTAGGGTGAAATAATAACCTGTCTTTGATTGTTTCATCAGATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTaag < 1:1532139/100‑2 (MQ=255) aGGGTGAAATAATAACCTGTCTTTGATTGTTTCATCAGATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTaagct < 1:3579797/100‑4 (MQ=255) ttcatcaGATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATa < 1:5484222/99‑1 (MQ=255) ttcatcaGATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATa < 1:5174785/99‑1 (MQ=255) ttcatcaGATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATa < 1:1919999/99‑1 (MQ=255) gATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGcacac < 1:1688688/100‑2 (MQ=255) aTGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCAcgta < 1:1357501/100‑4 (MQ=255) cAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACgtgtgt < 1:5038316/100‑1 (MQ=255) tttttAATTTCTTCTTTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTc < 1:2955525/100‑1 (MQ=255) tcttTAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTggcat < 1:2564429/100‑4 (MQ=255) tttAAGTCGCTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATGAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACta < 1:5756938/100‑2 (MQ=255) ccATACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAAtatgt > 1:1772198/1‑100 (MQ=255) aagaaCAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTCTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAAtatgt > 1:2540833/5‑100 (MQ=255) tctggggTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGc < 1:4142774/96‑1 (MQ=255) tACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGc < 1:5032441/100‑1 (MQ=255) tACAGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTCCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGc < 1:4082272/100‑1 (MQ=255) ctgggTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTgggca < 1:4909544/98‑4 (MQ=255) aGGGTCTAATGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGCAtt < 1:1870316/100‑1 (MQ=255) aTGAGTAAGCTATTAACTCTTCATATTCATCTTTTGTGATAAGCACGTGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATATGTGGCATTTCTATctt < 1:1516677/100‑1 (MQ=255) | CTAGGATGAAATAGTAATCTGTCCTTGATAGTCTCATCAGATGCAATTTTTAATTTCTTCTTTAAGTCACTCATGTTCCATACAGGGTCTAATGAATAACCAATTAGCTCATCATATTCATCTTTTGTGATAAGTACATGTGTTTCAGGTATTGGAACTGTTACGTTTAAAATGTGTGGCATTTCTATCTT > NC_007793/2120828‑2121018 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |