| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 49,251 | G→C | L554L (CTC→CTG) | SAUSA300_RS00210 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 49,251 | 0 | G | C | 100.0% | 36.5 / NA | 15 | L554L (CTC→CTG) | SAUSA300_RS00210 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (9/6); total (9/6) | |||||||||||
TCCCTTCATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGACGGTGTCCAATTTTGAAGTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCGAGGATAGATGCAAACTCTACATCTAATTTTAGATGGTAAAATACAAGTGATTGTTTTTTACCGCTATTATCTTTGACACTTCTTTTAGTTGTT > NC_007793/49157‑49344 | tCCCCTCATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGAt < 1:1228662/100‑1 (MQ=255)tCCCCTCATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGAt < 1:178216/100‑1 (MQ=255)tCCCCTCATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGAt < 1:2940632/100‑1 (MQ=255)tCCCCTCATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGAt < 1:3900929/100‑1 (MQ=255) ccccTCATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAAGAtc > 1:3578713/1‑99 (MQ=255) ccctCATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGATAg > 1:1198316/4‑100 (MQ=255) cATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCGGGATAGAtcg > 1:5485034/1‑98 (MQ=255) ttAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGATAGATGCaa < 1:5496053/100‑1 (MQ=255) ttgCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGATAGATGCaaa > 1:1685728/3‑100 (MQ=255) gCAGCTTTGTTATCATTTGCCGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGATAGATGCAAACTCTACATCTAATTTTAGATGGt > 1:4518139/1‑100 (MQ=255) gccGGTGTCCAATTTTGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGATAGATGCAAACTCTACATCTAATTTTAGATGGTAAAATACAAGTGATTGtt > 1:3480183/3‑100 (MQ=255) ttGAATTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCCAGGATAGATGCAAACTCTACATCTAATTTTAGATGGTAAAATACAAGTGATTGTTTTTTACCGccacac < 1:4469609/100‑6 (MQ=255) tATCTTTAGTTAATCCCAGGATAGATGCAAACTCTACATCTAATTTTAGATGGTAAAATACAAGTGATTGTTTTTTACCGCTATTATCTTTGACActtct > 1:4278032/1‑100 (MQ=255) ttAGTTAATCCCAGGATAGTTGCAAACTCTACATCTAATTTTAGATGGTAAAATACAAGTGATTGTTTTTTACCGCTATTATCTTTGACACTTCCTTTAg > 1:5645426/1‑100 (MQ=255) tAATCCCAGGATAGATGCAAACTCTACATCTAATTTTAGATGGTAAAATACAAGTGATTGGTTTTTACCGCTATTATCTTTGACACTTCTTTTAgttgtt > 1:1663540/1‑100 (MQ=255) | TCCCTTCATTAGCGGATTTAAAAAGTTCTTTCGCAGCTTTGTTATCATTTGACGGTGTCCAATTTTGAAGTAACGACTTATCTTTAGTTAATCCGAGGATAGATGCAAACTCTACATCTAATTTTAGATGGTAAAATACAAGTGATTGTTTTTTACCGCTATTATCTTTGACACTTCTTTTAGTTGTT > NC_007793/49157‑49344 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |