| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 48,697 | C→T | Q65Q (CAG→CAA) | SAUSA300_RS00205 ← | recombinase RecA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 48,697 | 0 | C | T | 100.0% | 23.2 / NA | 10 | Q65Q (CAG→CAA) | SAUSA300_RS00205 | recombinase RecA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (6/4); total (6/4) | |||||||||||
ATGAACATGGTACGTTTGACATAATTTGATGAGTTTTAATGCATTTTTCAGATTACGATGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACACTGTCCTTGTTGAATTAATTGTGTTATTTGTCGATACCCACTACGATTATCTTTGCGACCTGATTGTTTGTCGCTATAA > NC_007793/48601‑48775 | atGAACACGATATGTTTGACATAATTTGATGAGTTTTAATGCATTTTTCAAATTACGATGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACATTGt > 1:1763718/1‑100 (MQ=255) acacgatatgTTTGACATAATTTGATGAGTTTTAATGCATTTTTCAAATTACGATGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACATTGTCCtt > 1:3382374/10‑100 (MQ=255) tgatgaGTTTTGATGCATTTTTCAAATTACGATGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACATTGTCCTTGTTGCATTAATTGTGTCATTTg > 1:5385081/1‑100 (MQ=255) aaTGCATTTTTCAAATTACGATGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACATTGTCCTTGTTGAATTAATTGTGTCATTTGTCGATACCCAc > 1:5593967/1‑100 (MQ=255) tGCATTTTTCAAATTACGATGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACATTGTCCTTGTTGAATTAATTGTGTCATTTGTCGATACCCACTa < 1:1533822/100‑1 (MQ=255) aaaTTACGATGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACATTGTCCTTGCTGAATTAATTGTGTCATTTGTCGATACCCACTACGATTATCtt < 1:613144/98‑1 (MQ=255) tGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACATTGTCCTTGTTGAATTAATTGTGTCATTTGTCGATACCCACTACGATTATCTTTGCgtcggg < 1:3454938/100‑6 (MQ=255) tATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACATTGTCCTTGTTGAATTAATTGTGTCATTTGTCGATACCCACTACGATTATCTTTGCGTCCTGAttgttt < 1:4812794/100‑1 (MQ=255) aacttctaCGATAACAGCATAATATGTCACATTGTCCTTGTTGAATTAATTGTGTCATTTGTCGATACCCACTACGATTATCTTTGCGTCCTGAttgttt > 1:5305/8‑100 (MQ=255) aTAACAGCATAATATGTCACATTGTCCTTGTTGAATTAATTGTGTCATTTGTCGATACCCACTACGATTATCTTTGCGTCCTGATTGTTTGTCGCTATaa > 1:440428/1‑100 (MQ=255) | ATGAACATGGTACGTTTGACATAATTTGATGAGTTTTAATGCATTTTTCAGATTACGATGCAACCTATTAAGACGATAACAGCATAATATGTCACACTGTCCTTGTTGAATTAATTGTGTTATTTGTCGATACCCACTACGATTATCTTTGCGACCTGATTGTTTGTCGCTATAA > NC_007793/48601‑48775 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |