| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 2,004,352 | C→T | T202T (ACG→ACA) | SAUSA300_RS10065 ← | 2‑hydroxyacid dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 2,004,352 | 0 | C | T | 99.3% | 415.7 / NA | 148 | T202T (ACG→ACA) | SAUSA300_RS10065 | 2‑hydroxyacid dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (2/145); minor base G (0/1); total (2/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
TCTTTAACTATGCTACCTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGCGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGA > NC_007793/2004257‑2004448 | tcttTAACTATGCTACCTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGttt < 1:5780757/100‑1 (MQ=255) atcTATGCTCCCTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGt < 1:2265482/98‑1 (MQ=255) accTATGCTACCTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTGTCATTAATTCAAAATGTTTTTACTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTgga < 1:5478750/98‑2 (MQ=255) ttccgatcttcTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTa < 1:1716121/90‑1 (MQ=255) tcTACGCTGCCTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTa < 1:838131/99‑1 (MQ=255) ctcttccgatcTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTa < 1:953929/90‑1 (MQ=255) ctcttccgatcTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTa < 1:2938943/90‑1 (MQ=255) ctcttccgatcTCGTCATATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTa < 1:2207011/90‑1 (MQ=255) tcttccgatcTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTaa < 1:3935565/91‑1 (MQ=255) tcttccgatcTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTaa < 1:3182599/91‑1 (MQ=255) tcttccgatcTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTaa < 1:677871/91‑1 (MQ=255) ccgatcTACCTCTTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTaa < 1:1498808/95‑1 (MQ=255) cTATGCTACCTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTaa < 1:2231430/100‑1 (MQ=255) tccgatcTCGTACTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGc < 1:4079035/94‑1 (MQ=255) gTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTataat < 1:306333/100‑1 (MQ=255) tCCCATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTataata < 1:1428653/100‑1 (MQ=255) tctttATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:4887954/98‑1 (MQ=255) tatTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:4729622/100‑1 (MQ=255) tatTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:3297531/100‑1 (MQ=255) tatTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:1262578/100‑1 (MQ=255) tatTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:2506299/100‑1 (MQ=255) tatTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:617367/100‑1 (MQ=255) tatTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:2619822/100‑1 (MQ=255) tatTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:2622101/100‑1 (MQ=255) tatTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTCTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTc < 1:300325/100‑1 (MQ=255) atTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCa < 1:135370/100‑1 (MQ=255) tttATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTataatatcaatgt < 1:5109580/100‑8 (MQ=255) ttATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGc < 1:1608955/100‑1 (MQ=255) tataAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAgat < 1:4262123/100‑3 (MQ=255) ataAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGcta < 1:2710620/100‑3 (MQ=255) ataAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCAt < 1:747587/100‑1 (MQ=255) aaaaaGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCAttt < 1:3491217/100‑1 (MQ=255) aaaaGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTg < 1:2078947/100‑1 (MQ=255) tgctcttccgaTCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTgg < 1:4984684/90‑1 (MQ=255) tgctcttccgaTCTTGCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTgg < 1:4382051/90‑1 (MQ=255) gctcttccgaTCTTTCGTTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGt < 1:719303/91‑1 (MQ=255) aaGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGt < 1:2093170/100‑1 (MQ=255) ctcttccgaTCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTa < 1:1965181/92‑1 (MQ=255) ctcttccgaTCTTTCACTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTa < 1:4936130/92‑1 (MQ=255) aGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTa < 1:4103695/100‑1 (MQ=255) aGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTa < 1:1664423/100‑1 (MQ=255) aGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTa < 1:647199/100‑1 (MQ=255) aGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTa < 1:2677209/100‑1 (MQ=255) aGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTa < 1:1524097/100‑1 (MQ=255) tGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAAt < 1:131115/100‑1 (MQ=255) cttccgaTCTTTCATTAATTTAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTaag < 1:4638343/94‑2 (MQ=255) ttccgaTCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTGCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTaagt < 1:5568827/95‑3 (MQ=255) cgaTCTTTCATCAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGc < 1:3061456/98‑1 (MQ=255) aTCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGcgt < 1:5550985/100‑3 (MQ=255) aTCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCtt < 1:5253097/100‑1 (MQ=255) cattCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTc > 1:3758295/3‑100 (MQ=255) tttCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCa < 1:4730855/100‑1 (MQ=255) cttCATCAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCa < 1:2665367/99‑1 (MQ=255) aTTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGCTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTg < 1:3308721/100‑1 (MQ=255) tAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGAt < 1:2544945/100‑1 (MQ=255) cAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGAt < 1:3917917/100‑1 (MQ=255) tGTTTTTTCTTTAGTAAATGGATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGtat < 1:4855538/100‑1 (MQ=255) tGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGtat < 1:2292100/100‑1 (MQ=255) gTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGtata < 1:849965/100‑1 (MQ=255) ttttttCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGtatat < 1:2139401/100‑1 (MQ=255) ttttttCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGtatag < 1:3734894/100‑2 (MQ=255) tAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTcg < 1:1156739/100‑2 (MQ=255) tAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCa < 1:1812935/100‑1 (MQ=255) tAGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCa < 1:1091284/100‑1 (MQ=255) aGTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTcgt < 1:1019262/100‑3 (MQ=255) gTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCaag < 1:5012159/100‑2 (MQ=255) gTAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCaaa < 1:3701414/100‑1 (MQ=255) tAAATGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCaaaa < 1:2665710/100‑2 (MQ=255) aTGAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCa < 1:2367403/100‑1 (MQ=255) gAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCagg < 1:5158690/100‑3 (MQ=255) gAATCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATc < 1:5389597/100‑1 (MQ=255) aTCGTTTCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATGATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCtt < 1:3424865/100‑1 (MQ=255) tttCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTgag < 1:5732226/100‑3 (MQ=255) ttCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTc < 1:5320563/100‑1 (MQ=255) tCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTct < 1:1053892/100‑1 (MQ=255) tCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTct < 1:3538905/100‑1 (MQ=255) tCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTct < 1:614756/100‑1 (MQ=255) tCTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTct < 1:2224307/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:5605273/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:930085/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:1145460/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:1330898/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:13337/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:1589391/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:1954391/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:215700/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:5606807/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:4655589/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:2856275/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:2874705/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:5462685/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:5396060/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:3693128/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:5143520/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:4280203/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTcat < 1:4196161/100‑3 (MQ=255) cTTGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATATCAGCATTTGGTAATGCGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:2352057/100‑1 (MQ=255) cTTGTGTCTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctg < 1:3184703/100‑1 (MQ=255) ttGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctgg < 1:1840489/100‑2 (MQ=255) ttGTGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTctga < 1:5323776/100‑1 (MQ=255) | TCTTTAACTATGCTACCTCGTCCTATATTTATAAAAAGTGCTTCATCTTTCATTAATTCAAAATGTTTTTTCTTTAGTAAATGAATCGTTTCTTGCGTTTCTGGTAAAGCATTTATAATAATGTCAGCATTTGGTAATGTGCTTTCAAGTGATTCGATAGTATATATCTCGTCAAACTCATCTTTGTTCTGA > NC_007793/2004257‑2004448 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |