| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_007793 | 1,863,084 | T→G | K114Q (AAA→CAA) | SAUSA300_RS09220 ← | cell division protein FtsK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_007793 | 1,863,084 | 0 | T | G | 99.8% | 1216.6 / NA | 438 | K114Q (AAA→CAA) | SAUSA300_RS09220 | cell division protein FtsK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (20/417); minor base A (0/1); total (20/418) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 453 total aligned reads displayed.
TTAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTAT‑ATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACGTTTTTCACTATAATTTTGTTCTTCAGTTGTTTGATTTCTTCTACGGCGATGTCGTTTTTGTGAACGAGAATCGTGGCTTTGTTTGCGATAGTCTCGATG > NC_007793/1862987‑1863180 | ttAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTAT‑ATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACgttgtt < 1:2652749/100‑1 (MQ=255)ttAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTAT‑ATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACgttgtt < 1:3437812/100‑1 (MQ=255) tAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTAT‑ATTTTATACTTTGCTGTTATATTTTAGAATTCCCACGTTGTTc < 1:3201683/100‑1 (MQ=255) tAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTAT‑ATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACgttgttg < 1:5310654/100‑2 (MQ=255) tAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTAT‑ATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACGTTGTTc < 1:3272510/100‑1 (MQ=255) tAATTGCAGAAACATATGTACCTGGCTTATTCGTATGGTAATGTGAATGATCTTTAT‑ATTTTATACTTTGCTGTGATATTTTAGAATTCCCACGTTGTTc < 1:3005756/100‑1 (MQ=255) 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NC_007793/1862987‑1863180 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |