| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,661,769 | T→C | N683D (AAT→GAT) | SAUSA300_RS08255 ← | penicillin‑binding protein 3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,661,769 | 0 | T | C | 99.5% | 581.7 / NA | 199 | N683D (AAT→GAT) | SAUSA300_RS08255 | penicillin‑binding protein 3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (2/196); minor base A (0/1); total (2/197) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
ACATCTATAATATTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATTTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTGATTTGTATATACA > NC_007793/1661675‑1661863 | aCATCTATAATATTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTAc < 1:2134076/100‑1 (MQ=255) aTCTATAATATTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCt < 1:2440465/100‑1 (MQ=255) aTCTATAATATTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCt < 1:3656508/100‑1 (MQ=255) aTCTATAATATTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCt < 1:4812736/100‑1 (MQ=255) tCTATAATATTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTa < 1:2381014/100‑1 (MQ=255) aataTTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGc < 1:4068270/100‑1 (MQ=255) atatTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCt < 1:2829104/100‑1 (MQ=255) atatTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCt < 1:3760301/100‑1 (MQ=255) tatTTGCAAAGTTAAAATTTTATAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCtt < 1:3158670/100‑1 (MQ=255) tatTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCtt < 1:1169275/100‑1 (MQ=255) tatTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCtt < 1:559979/100‑1 (MQ=255) tatTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCtt < 1:1727566/100‑1 (MQ=255) tatTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCtt < 1:4926982/100‑1 (MQ=255) tatTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCtg < 1:323344/100‑2 (MQ=255) tatTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCCTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCtt < 1:2579018/100‑1 (MQ=255) atTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTa < 1:2121662/100‑1 (MQ=255) atTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTAACATCTTTACCTAACTGCtgc < 1:2271681/100‑3 (MQ=255) tttGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACCCAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTaa < 1:2465832/100‑1 (MQ=255) tttGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATTGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTat < 1:1133344/100‑2 (MQ=255) tttGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTag < 1:2186729/100‑2 (MQ=255) tGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCt < 1:2456473/100‑1 (MQ=255) gcgcTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTa < 1:5731259/100‑1 (MQ=255) gcgcTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTa < 1:1863313/100‑1 (MQ=255) tACACAATCGTCGGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGtc < 1:3847449/100‑1 (MQ=255) cacaATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCGTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGtctc < 1:3705139/100‑1 (MQ=255) aTCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTcctat < 1:3592174/100‑4 (MQ=255) tctgtgggTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCt < 1:5379485/94‑1 (MQ=255) ctgTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCAccc < 1:5635770/98‑2 (MQ=255) gTCATGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTga < 1:290877/100‑2 (MQ=255) gTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTATCTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGt < 1:1445279/100‑1 (MQ=255) gTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCtag < 1:57077/100‑3 (MQ=255) gTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTgc < 1:5485735/100‑2 (MQ=255) gTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGt < 1:4257315/100‑1 (MQ=255) tCATGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTggc < 1:4707166/100‑3 (MQ=255) tCAGTTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:5163624/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTTCTTAAAGTATTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:4778511/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:2630731/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:5694714/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:832570/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:532909/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:350021/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:1642420/100‑1 (MQ=255) tCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATCTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:4970674/100‑1 (MQ=255) gttggTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:2013213/97‑1 (MQ=255) gatggTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGtt < 1:1526382/97‑1 (MQ=255) cctgTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:2716387/97‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:2665269/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:3757653/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:362301/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:3582864/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:4435024/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:755058/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:4222462/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:2417564/100‑1 (MQ=255) cAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCCTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTa < 1:4795752/100‑1 (MQ=255) aGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCtcacac < 1:1696747/100‑6 (MQ=255) aGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTaa < 1:4774077/100‑1 (MQ=255) aGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTaa < 1:5496177/100‑1 (MQ=255) gTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAAcc < 1:2801780/100‑1 (MQ=255) ttAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCa < 1:2327691/100‑1 (MQ=255) ttAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCa < 1:1951787/100‑1 (MQ=255) aaaTTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCAtg < 1:5074644/100‑1 (MQ=255) aaaTTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCAta < 1:1594590/100‑2 (MQ=255) tccgatctgtgtctttgtcttTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCAtgg < 1:1788161/91‑1 (MQ=255) ctcttccgatctttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCAtggtg < 1:522784/91‑1 (MQ=255) tgtctttgtcttTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTAc < 1:2093519/100‑1 (MQ=255) tgtctttgtcttTATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTAc < 1:464762/100‑1 (MQ=255) gatctttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTAc < 1:3271127/98‑1 (MQ=255) gatctttgtcattATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCAtggtggtggggc < 1:3420631/98‑4 (MQ=255) atcttttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTAc < 1:920571/96‑1 (MQ=255) atcttttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTAc < 1:3666762/96‑1 (MQ=255) tcttccgatcttATTCTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACa < 1:4013887/90‑1 (MQ=255) ttccgatctttATTATTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACac < 1:2249689/94‑2 (MQ=255) tctttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCAtggtggtgggcaca < 1:902020/100‑6 (MQ=255) ttttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTAccac < 1:208677/99‑4 (MQ=255) gatctttctgtttttATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGc < 1:5787563/90‑1 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGca < 1:3828107/100‑2 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCt < 1:4411226/100‑1 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCt < 1:4348151/100‑1 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCt < 1:4940961/100‑1 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCt < 1:3888935/100‑1 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCt < 1:3730513/100‑1 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCt < 1:1388212/100‑1 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCt < 1:3094410/100‑1 (MQ=255) ttgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCt < 1:3389011/100‑1 (MQ=255) tgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTg < 1:3786550/100‑1 (MQ=255) tgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTg < 1:2496823/100‑1 (MQ=255) tgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTg < 1:4764722/100‑1 (MQ=255) tgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTg < 1:4477151/100‑1 (MQ=255) tgtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTg < 1:1148407/100‑1 (MQ=255) atcttatATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCtt < 1:78902/94‑2 (MQ=255) gtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTgg < 1:4843994/100‑2 (MQ=255) gtctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTgc < 1:3367664/100‑2 (MQ=255) atctatATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTgc < 1:5417752/99‑2 (MQ=255) tctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTgtt < 1:3432282/100‑3 (MQ=255) tctttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTgca < 1:4860387/100‑3 (MQ=255) tttATTTTTATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTGAttt < 1:3137106/100‑1 (MQ=255) tcttttttATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTGATTTg < 1:4687727/97‑1 (MQ=255) tttttATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTGATTTGtat < 1:687438/100‑1 (MQ=255) tttttATCATCTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTGATTTGtat < 1:2072253/100‑1 (MQ=255) | ACATCTATAATATTTGCAAAGTTAAAATTTTACAACCATGCGCTACACAATCGTCAGGTTAAATTTTATTTGTCTTTGTCTTTATTTTTATCATTTTTACCTAACTGCTTAAAGTAGTAGTTAATTACATCTCTACCTAAGTCTCCACCTGTTAACCATGGTGGTGGTACAGGCTGATTTGTATATACA > NC_007793/1661675‑1661863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |