Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_007793	1,638,466	C→A	G470G (GGG→GGT)	SAUSA300_RS08095 ←	ATPase AAA

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	1,638,466	0	C	A	100.0%	38.0 / NA	15	G470G (GGG→GGT)	SAUSA300_RS08095	ATPase AAA
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (3/12);  total (3/12)

AAACTCAGATTTTGGATCCCAGTACAACATTTGACCTTTAAAAAATGATGTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTCCCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCGGCCAACAATAAACTA  >  NC_007793/1638376‑1638544                                                                                           |                                                                               aaaCTCAGATTTTGGATCCCAGTACAACATTTGACCTTTAAAAAATGATGTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAggtact                                                                       <  1:231648/100‑6 (MQ=255)    cTCAGATTTTGGATCCCAGTACAACATTTGACCTTTAAAAAATGATGTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCa                                                                    >  1:3271926/1‑100 (MQ=255)                    cAGTACAACATTTGACCTTTAAAAAATGATGTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCg                                                    >  1:2801115/1‑100 (MQ=255)                                 gACCTTTAAAAAATGATGTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGAc                                       >  1:1268589/1‑100 (MQ=255)                                 gACCTTTAAAAAATGATGTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGAc                                       <  1:678169/100‑1 (MQ=255)                                           aaaTGATGTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGTCCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTa                             <  1:825957/100‑1 (MQ=255)                                                 tgTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCt                       <  1:31636/100‑1 (MQ=255)                                                      aaaTCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGc                  <  1:1661364/100‑1 (MQ=255)                                                         tCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCggg               <  1:4005358/100‑2 (MQ=255)                                                          ccATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCGGcc              <  1:23842/100‑1 (MQ=255)                                                             taataaTTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCGGCcaac           <  1:2396707/100‑1 (MQ=255)                                                             taataaTTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCGGCcaac           <  1:4617953/100‑1 (MQ=255)                                                              aataatTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCGGCcaaca          <  1:2410468/100‑1 (MQ=255)                                                                 aatTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCGGCCAACAAta       <  1:4983623/100‑1 (MQ=255)                                                                      tGCTAAAAATGATTTACCTTTACCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCGGCCAACAAtaaacta  <  1:4599263/100‑1 (MQ=255)                                                                                           |                                                                               AAACTCAGATTTTGGATCCCAGTACAACATTTGACCTTTAAAAAATGATGTATAAATCCATAATAATTTTGCTAAAAATGATTTACCTTTCCCAGTTTGACCAGTAATTAAAACATGCGGACTATCACTGACAGCCCCCTTAATACCTTTTGCGGCCAACAATAAACTA  >  NC_007793/1638376‑1638544

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑