D66 :: BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_007793	1,503,364	C→T	D21N (GAC→AAC)	SAUSA300_RS07295 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	1,503,364	0	C	T	99.8%	1384.9 / NA	486	D21N (GAC→AAC)	SAUSA300_RS07295	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (3/482); total (3/483)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01

Only 100 of 487 total aligned reads displayed.

CATTTGCCCTTGTATTAACACCCATTCTAATCCTTCATCCAACAGTTGTTCAATTTTATGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTCATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCATCTAATATATTT  >  NC_007793/1503266‑1503459

                   ccccATTCTAATCCTTCCTCCAACAGTTGTTCAATTTTATGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAAtt                                                                             >  1:5567469/2‑100 (MQ=255)

                                 ttCATCCAACAGTTGTTCAATTTTATGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTag                                                               <  1:686950/100‑2 (MQ=255)

                                       cAACAGTTGTTCAATTTTATGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGtt                                                         <  1:5278517/100‑1 (MQ=255)

                                       cAACAGTTGTTCAATTTTATGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGtg                                                         <  1:3713572/100‑2 (MQ=255)

                                       cAACAGTTGTTCAATTTTATGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGCGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGtc                                                         <  1:782852/100‑2 (MQ=255)

                                                         aTGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAAcc                                       <  1:2353696/100‑1 (MQ=255)

                                                         aTGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAAcc                                       <  1:4848148/100‑1 (MQ=255)

                                                            ttttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATc                                    <  1:925099/100‑1 (MQ=255)

                                                            ttttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATc                                    <  1:2465231/100‑1 (MQ=255)

                                                            ttttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATc                                    <  1:425306/100‑1 (MQ=255)

                                                            ttttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATc                                    <  1:1550693/100‑1 (MQ=255)

                                                            ttttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATc                                    <  1:4579349/100‑1 (MQ=255)

                                                            ttttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATc                                    <  1:5486444/100‑1 (MQ=255)

                                                            ttttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATc                                    <  1:5602560/100‑1 (MQ=255)

                                                            ttttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTAACTTTAAAAATGTTTAATTCGAATAATTAGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATc                                    <  1:4499782/100‑1 (MQ=255)

                                                             tttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCa                                   <  1:1518789/100‑1 (MQ=255)

                                                              ttATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAg                                  <  1:2293801/100‑1 (MQ=255)

                                                               tataAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGt                                 <  1:3478021/100‑1 (MQ=255)

                                                               tataAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGt                                 <  1:2907806/100‑1 (MQ=255)

                                                                  aaaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAcc                              <  1:3211483/100‑1 (MQ=255)

                                                                  aaaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAcc                              <  1:2619709/100‑1 (MQ=255)

                                                                  aaaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAcc                              <  1:722364/100‑1 (MQ=255)

                                                                  aaaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTCAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAcc                              <  1:1999920/100‑1 (MQ=255)

                                                                  aaaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATATTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAcc                              <  1:1042224/100‑1 (MQ=255)

                                                                   aaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAccc                             <  1:2967243/100‑1 (MQ=255)

                                                                   aaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAccc                             <  1:2808389/100‑1 (MQ=255)

                                                                   aaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAccc                             <  1:1084694/100‑1 (MQ=255)

                                                                   aaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAccc                             <  1:1940300/100‑1 (MQ=255)

                                                                   aaTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAccc                             <  1:3612848/100‑1 (MQ=255)

                                                                   aaTTGTTTTAAATAATGAACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAccc                             <  1:4291697/100‑1 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAcccg                            <  1:3403897/100‑2 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAcccg                            <  1:4721793/100‑2 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAcccc                            <  1:3842888/100‑2 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAccca                            <  1:439220/100‑2 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCct                            <  1:650156/100‑1 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCct                            <  1:1884110/100‑1 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCct                            <  1:3645257/100‑1 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCct                            <  1:1222066/100‑1 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCct                            <  1:5017333/100‑1 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCct                            <  1:3421799/100‑1 (MQ=255)

                                                                    aTTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAACGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTAccca                            <  1:3768331/100‑2 (MQ=255)

                                                                     ttGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCctt                           <  1:2261771/100‑2 (MQ=255)

                                                                     ttGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCcta                           <  1:148266/100‑2 (MQ=255)

                                                                      tGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGCTTTAACCATCAGTACCctca                          <  1:1792548/100‑2 (MQ=255)

                                                                       gTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCctcac                         <  1:4067476/100‑3 (MQ=255)

                                                                       gTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCctagt                         <  1:112644/100‑4 (MQ=255)

                                                                       gTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGCACCctctg                         <  1:4550100/100‑2 (MQ=255)

                                                                       gTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCAGCacaccccatca                         <  1:5421287/100‑11 (MQ=255)

                                                                        ttttAAATAATGTACTCCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCctagat                        <  1:5333181/100‑5 (MQ=255)

                                                                           tAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTgg                     <  1:2541702/100‑2 (MQ=255)

                                                                           tAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGt                     <  1:2665313/100‑1 (MQ=255)

                                                                           tAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGt                     <  1:5642328/100‑1 (MQ=255)

                                                                           tAAATAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGt                     <  1:1253726/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTGCTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:5118032/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:4960788/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:4650115/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:815028/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:1289059/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:894416/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:1358614/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:1649411/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:4175928/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:3085383/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtt                    <  1:3567101/100‑1 (MQ=255)

                                                                            aaaTAATGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtg                    <  1:5219506/100‑2 (MQ=255)

                                                                             aataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGtgg                   <  1:4195262/100‑3 (MQ=255)

                                                                             aataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTa                   <  1:2733753/100‑1 (MQ=255)

                                                                             aataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTa                   <  1:5181458/100‑1 (MQ=255)

                                                                              ataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTggcac                  <  1:2581921/100‑5 (MQ=255)

                                                                              ataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTat                  <  1:4431888/100‑2 (MQ=255)

                                                                              ataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAc                  <  1:1706387/100‑1 (MQ=255)

                                                                              ataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAc                  <  1:2847579/100‑1 (MQ=255)

                                                                              ataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAc                  <  1:3171439/100‑1 (MQ=255)

                                                                              ataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAc                  <  1:2153927/100‑1 (MQ=255)

                                                                              ataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAc                  <  1:3885712/100‑1 (MQ=255)

                                                                              ataatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAc                  <  1:867551/100‑1 (MQ=255)

                                                                               taatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAct                 <  1:1611540/100‑2 (MQ=255)

                                                                               taatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAca                 <  1:4776362/100‑2 (MQ=255)

                                                                               taatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTAca                 <  1:62492/100‑2 (MQ=255)

                                                                               taatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCATTTGTTAca                 <  1:5689728/100‑2 (MQ=255)

                                                                               taatGTACTTCAGGTGCGTTATCGTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACg                 <  1:2485096/100‑1 (MQ=255)

                                                                                aatGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACgg                <  1:3976757/100‑2 (MQ=255)

                                                                                 atGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGcc               <  1:2401337/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 atGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGcc               <  1:5771139/100‑1 (MQ=255)

                                                                                  tccgatctaGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCa              <  1:4331752/92‑1 (MQ=255)

                                                                                  tGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCa              <  1:1146849/100‑1 (MQ=255)

                                                                                  tGTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCa              <  1:5132437/100‑1 (MQ=255)

                                                                                   gTACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCag             <  1:5383633/100‑2 (MQ=255)

                                                                                    tACTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCaga            <  1:2057565/100‑3 (MQ=255)

                                                                                     gatctaGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCAtag           <  1:3361702/95‑3 (MQ=255)

                                                                                     aCTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTGCATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCATca           <  1:2229721/100‑2 (MQ=255)

                                                                                     aCTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCagga           <  1:3319009/100‑4 (MQ=255)

                                                                                     aCTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCaaca           <  1:4617423/100‑4 (MQ=255)

                                                                                     aCTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCAttg           <  1:3805810/100‑3 (MQ=255)

                                                                                     aCTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCAtaa           <  1:100129/100‑3 (MQ=255)

                                                                                     aCTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCATCt           <  1:1845835/100‑1 (MQ=255)

                                                                                     aCTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCATCt           <  1:3924780/100‑1 (MQ=255)

                                                                                      cTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCATcag          <  1:1384786/100‑3 (MQ=255)

                                                                                      cTTCAGGTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCATCTa          <  1:2991560/100‑1 (MQ=255)

                                                                                          tggTGCGTTATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCATCTAatat      <  1:1675043/99‑1 (MQ=255)

CATTTGCCCTTGTATTAACACCCATTCTAATCCTTCATCCAACAGTTGTTCAATTTTATGTTTTATAAATTGTTTTAAATAATGTACTTCAGGTGCGTCATCTTTAAAAATGTTTAATTCGAATGATTTGTAACCTGTTACATAAACTGTTTTAACCATCAGTACCCTCTTTTGTTACGCCATCTAATATATTT  >  NC_007793/1503266‑1503459

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 19 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 37 ≤` `ATCG/ATCG` `< 39 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`