Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 1,458,928 A→C Y9717D (TAT→GAT)  SAUSA300_RS07235 ← hyperosmolarity resistance protein Ebh

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0077931,458,9280AC100.0% 144.7 / NA 53Y9717D (TAT→GAT) SAUSA300_RS07235hyperosmolarity resistance protein Ebh
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base C (3/50);  total (3/50)

GCTTGTGCAAGTTGTGCTTTTGCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATATTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGAACTTGTTT  >  NC_007793/1458831‑1459003
                                                                                                 |                                                                           
gCTTGTGCAAGTTGTGCTTTTGCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCtt                                                                           >  1:4059320/1‑100 (MQ=255)
   tgtgCAAGTTGTGCTTTTGCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTaa                                                                        >  1:1732276/1‑100 (MQ=255)
          gTTGTGCTTTTGCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTg                                                                 <  1:367101/100‑1 (MQ=255)
                         gCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGCATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCCGt                                                  >  1:1376455/1‑100 (MQ=255)
                          tttccgatcttctTCAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGCTCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2661364/93‑1 (MQ=11)
                          ttCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3970840/99‑1 (MQ=25)
                          gtCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:1693309/99‑1 (MQ=25)
                          cttgaTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3159327/96‑1 (MQ=255)
                          ctctATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2590065/100‑1 (MQ=255)
                          cctgaTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2028452/96‑1 (MQ=255)
                          cccAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:4630212/98‑1 (MQ=255)
                          cTCGATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:4704297/100‑1 (MQ=255)
                          cTCGATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:4389799/100‑1 (MQ=255)
                          cTCGATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2717647/100‑1 (MQ=255)
                          cTCCATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:1488192/100‑1 (MQ=255)
                          cTCATTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:1117426/100‑1 (MQ=255)
                          cTCATTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:833783/100‑1 (MQ=255)
                          cTCATTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:4877113/100‑1 (MQ=255)
                          cTCAGTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGGCCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:4421911/100‑1 (MQ=255)
                          cTCAGTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2978957/100‑1 (MQ=255)
                          cTCAGTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3353080/100‑1 (MQ=255)
                          cTCACTTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:270462/100‑1 (MQ=255)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCGGCGCATTATTAATGTCGTTCTGTCCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGTTCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:4297345/100‑1 (MQ=11)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGGTTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2142613/100‑1 (MQ=255)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:440919/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:545700/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:5724133/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3476374/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3532428/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2113898/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2751285/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:2868282/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:1771906/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3060611/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3202018/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3391990/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:3486681/100‑1 (MQ=38)
                          cTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGAACTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:1661862/100‑1 (MQ=255)
                          cTCAATTTCTTCATTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:5199887/100‑1 (MQ=255)
                          cTCAATTTCTCCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGtt                                                 <  1:4144122/100‑1 (MQ=255)
                              cgatcttctTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAgca                                             <  1:4031395/97‑3 (MQ=255)
                                     cttTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGAtt                                      <  1:596348/100‑1 (MQ=25)
                                      tttAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGAttt                                     <  1:5710229/100‑1 (MQ=25)
                                      tttAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGAttt                                     <  1:1255694/100‑1 (MQ=25)
                                      tttAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGAttt                                     <  1:3540053/100‑1 (MQ=25)
                                                                tATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTg           <  1:2762907/100‑1 (MQ=255)
                                                                 aTGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTgt          <  1:2020356/100‑2 (MQ=255)
                                                                 aTGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTgt          <  1:3013441/100‑2 (MQ=255)
                                                                 aTGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTgt          <  1:430363/100‑2 (MQ=255)
                                                                 aTGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTgt          <  1:3721328/100‑2 (MQ=255)
                                                                   gACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGTAc        <  1:393057/100‑1 (MQ=255)
                                                                         gttgAAGTATTTGATTAATTCGTTCTTTAAGTTCTTGTTTTTCCTTATCGGTTAGATTTGTATTTTGAACGATTGCGTCAATTAAAGCTTGTACACGttt  <  1:797016/100‑1 (MQ=14)
                                                                         gttgAAGTATTTGATTAATTCGATCTTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGTAcaccaca  <  1:4373685/100‑7 (MQ=14)
                                                                                                 |                                                                           
GCTTGTGCAAGTTGTGCTTTTGCCTGCTCAATTTCTTCTTTAGTCAGCGCATTGTTAATGTCGTTATGACCTTGTTGAAGTATTTGATTAATTCGATATTTAAGTGCTTGTTTTTCCTTATCTGTTAGATTTGGATTTTGATCGATTTCGTCAATTAAAGCTTGAACTTGTTT  >  NC_007793/1458831‑1459003

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑