Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_007793 1,445,143 G→T L120I (CTT→ATT)  SAUSA300_RS07140 ← UDP‑N‑acetylglucosamine‑‑N‑acetylmuramyl‑ (pentapeptide) pyrophosphoryl‑undecaprenol N‑acetylglucosamine transferase

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  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0077931,445,1430GT100.0% 207.5 / NA 75L120I (CTT→ATT) SAUSA300_RS07140UDP‑N‑acetylglucosamine‑‑N‑acetylmuramyl‑ (pentapeptide) pyrophosphoryl‑undecaprenol N‑acetylglucosamine transferase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base T (1/74);  total (1/74)

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                  gttgtATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAATAGTTGGTATATTTAATGATTTgg                                                                       <  1:4794809/100‑1 (MQ=255)
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                                                   aTCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAATAGTTGGTATATTTAATGATTTGGCTGCAATAACAACAGGCACAGATACAAATCCat                                      <  1:5354432/100‑2 (MQ=255)
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                                                                                              |                                                                                            
TTTAGCGTTTCTTCAAATGTTGTATATATTTTCTTGGCAAATTTAAGTGCTATCTTATTCGCTAATCCTGGTGTTAAGTCAGATTCATGAATAAGAGTTGGTATATTTAATGATTTGGCTGCAATAACAACAGGCACAGATACAAATCCACCTTTTGAAAATAATAGATCAGGTTTTTCTTTTTTCA  >  NC_007793/1445049‑1445235

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑