| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,433,527 | C→T | G189D (GGT→GAT) | SAUSA300_RS07085 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,433,527 | 0 | C | T | 100.0% | 42.3 / NA | 17 | G189D (GGT→GAT) | SAUSA300_RS07085 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (2/15); total (2/15) | |||||||||||
CGGATACTAGCGGCTTCTTCAGAAATTTGTCCCTGCTTAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCACCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAATATAATCAACGTGAATAACAACAAAGCGATTTTTTAGTGCT > NC_007793/1433434‑1433619 | tccgatcTAGCGGCTTCTTCAGAAATTTGTCCCTGCTTAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGta < 1:3986021/94‑1 (MQ=255)cGGATACTAGCGGCTTCTTCAGAAATTTGTCCCTGCTTAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGta < 1:1694348/100‑1 (MQ=255) tccgatctGTCCCAGCTTAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATc < 1:5052427/93‑1 (MQ=255) cgatctCCCTGCTTAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACAt < 1:1513188/95‑1 (MQ=255) cccTGCTTAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTa < 1:169842/100‑1 (MQ=255) gcTGCTTAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTaa > 1:4436715/2‑100 (MQ=255) tAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTc > 1:3527159/1‑100 (MQ=255) gTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCaa < 1:5002681/100‑1 (MQ=255) tACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAat < 1:2784184/100‑1 (MQ=255) aCGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCaaga < 1:4106174/100‑3 (MQ=255) cGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAatat < 1:291403/100‑1 (MQ=255) aaTCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAATATAATc < 1:4588981/100‑1 (MQ=255) aaTCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAATATAATc < 1:5652466/100‑1 (MQ=255) aTCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAAtatagcac < 1:4305599/100‑5 (MQ=255) aTCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCCTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAATATAATCa < 1:4661195/100‑1 (MQ=255) tCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAATATAATCat < 1:764608/100‑2 (MQ=255) tttATCATCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAATATAATCAACGTGAATAACAACAAAGCGATTTTTTAGTGCt < 1:4206343/100‑1 (MQ=255) | CGGATACTAGCGGCTTCTTCAGAAATTTGTCCCTGCTTAGACATAGTACGTAAATCTTCATTAAACTTAATAATTTGTTCGATTTGTTTATCACCTTGTAATAAACTTTGCTCTTTAATCACATTTTTTAAAATGTCCCCATCAATATAATCAACGTGAATAACAACAAAGCGATTTTTTAGTGCT > NC_007793/1433434‑1433619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |