| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,287,783 | A→G | I488V (ATT→GTT) | SAUSA300_RS06325 → | cell division protein FtsK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,287,783 | 0 | A | G | 99.4% | 503.1 / ‑5.5 | 176 | I488V (ATT→GTT) | SAUSA300_RS06325 | cell division protein FtsK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (170/5); total (171/5) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CCAATTACTGTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTATTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAATGTTTATAACGGAATTCCACACTTA > NC_007793/1287687‑1287875 | ccAATTACTGTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGttt > 1:1734034/1‑100 (MQ=255)ccAATTACTGTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGttt > 1:525785/1‑100 (MQ=255) aaTTACTGTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTtta > 1:1124743/1‑100 (MQ=255) aaTTACTGTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTtta > 1:5588881/1‑100 (MQ=255) tACTGTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTttatta > 1:430588/1‑100 (MQ=255) ccTGTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTaa > 1:3848825/2‑100 (MQ=255) gTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATg > 1:3725618/1‑100 (MQ=255) ccACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTa > 1:1242980/1‑100 (MQ=255) aaatgaaatgCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCg > 1:3692999/1‑100 (MQ=255) aaatgaaatgCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCg > 1:719357/1‑100 (MQ=255) ctgtgcttgCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGc > 1:4388432/8‑100 (MQ=255) aacgaaatgCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTGAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGc < 1:312657/97‑1 (MQ=255) atgaaatgCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGcg < 1:5027720/100‑2 (MQ=255) atgaaatgCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCa > 1:1710843/1‑100 (MQ=255) gaaatgCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCaag < 1:3735355/100‑3 (MQ=255) acgacacTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGAAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCagatcgga > 1:5432027/4‑93 (MQ=255) tcacaCTTATTGGTGGCAGGAGCGACGGGAAGAGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGATTTATTAAATGCTATGCCGCATGCAGTTa > 1:3489554/2‑100 (MQ=255) atgttGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTa > 1:2459663/4‑100 (MQ=255) tATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACatat > 1:5681612/1‑100 (MQ=255) tATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTAt > 1:1712048/1‑100 (MQ=255) tATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTAt > 1:5174233/1‑100 (MQ=255) tATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTAt > 1:120312/1‑100 (MQ=255) tATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGCAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTAt > 1:2770308/1‑100 (MQ=255) tATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGAGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTAt > 1:2224361/1‑100 (MQ=255) aTTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATg > 1:2556256/1‑100 (MQ=255) aTTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATg > 1:1009918/1‑100 (MQ=255) ttGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGt > 1:4077465/1‑100 (MQ=255) ttGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGt > 1:486820/1‑100 (MQ=255) ttGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGt > 1:1355089/1‑100 (MQ=255) ttGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGt > 1:908450/1‑100 (MQ=255) ttGGTGGCAGGATCGACGGATAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGt > 1:969831/1‑100 (MQ=255) gtggtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGt > 1:3867298/2‑100 (MQ=255) tggtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGtt > 1:925260/1‑100 (MQ=255) tggtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGtt > 1:1555164/1‑100 (MQ=255) tggtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGtt > 1:1929884/1‑100 (MQ=255) tggtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGtt > 1:3216424/1‑100 (MQ=255) 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1:4353576/1‑100 (MQ=255) ggtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTa > 1:2805149/1‑100 (MQ=255) ggtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTa > 1:1218787/1‑100 (MQ=255) agtggCAGGATCGTCGGGGAGTGGTAAATCTGGTTGTATAAATGGGATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTa > 1:4147200/2‑100 (MQ=255) gtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAGTCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTaa > 1:3524796/1‑100 (MQ=255) gtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAGACTTATGTTaa > 1:1613102/1‑100 (MQ=255) gtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTaa > 1:2040030/1‑100 (MQ=255) gtggCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTaa > 1:5663978/1‑100 (MQ=255) 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1:3387058/2‑100 (MQ=255) tAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGtt > 1:2194333/1‑100 (MQ=255) aGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTg > 1:1442096/1‑100 (MQ=255) ctGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGa > 1:2275140/2‑100 (MQ=255) ggTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAAc > 1:4934113/1‑100 (MQ=255) aTCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGCTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAAt > 1:249186/1‑100 (MQ=255) tGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAATGtt < 1:3713689/100‑1 (MQ=255) gTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAATGttt > 1:418016/1‑100 (MQ=255) gTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAATGctt > 1:2675956/1‑100 (MQ=255) cctGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAATGTTTATAACGGaa > 1:5403043/3‑100 (MQ=255) aaTGGTATTATTACAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAATGTTTATAACGGaa > 1:789052/1‑100 (MQ=255) caCAAGTGTTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAATGTTTATAACGGAATTCCACACtta > 1:1060579/2‑100 (MQ=255) | CCAATTACTGTTCCACTAAATGAAATGCCACACTTATTGGTGGCAGGATCGACGGGTAGTGGTAAATCTGTTTGTATAAATGGTATTATTACAAGTATTTTATTAAATGCTAAGCCGCATGAAGTTAAACTTATGTTAATCGATCCGAAAATGGTTGAACTAAATGTTTATAACGGAATTCCACACTTA > NC_007793/1287687‑1287875 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |