| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,231,332 | A→G | intergenic (+84/+39) | SAUSA300_RS06080 → / ← SAUSA300_RS06085 | beta‑ketoacyl‑ACP reductase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,231,332 | 0 | A | G | 99.6% | 1918.3 / ‑3.9 | 726 | intergenic (+84/+39) | SAUSA300_RS06080/SAUSA300_RS06085 | beta‑ketoacyl‑ACP reductase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base G (718/2); minor base T (3/0); total (724/2) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 729 total aligned reads displayed.
AATGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTCTACTTGTTT > NC_007793/1231236‑1231424 | ttGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGCTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAAtt > 1:2264723/2‑100 (MQ=255) gtGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAAtt > 1:4508442/2‑100 (MQ=255) ctGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAAtt > 1:2724757/2‑100 (MQ=255) aTGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTTAACTTTGCGGGGGGAAtt > 1:695082/1‑100 (MQ=255) aTGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAAtt > 1:1357232/1‑100 (MQ=255) aTGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAAtt > 1:2355335/1‑100 (MQ=255) gTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCt > 1:3205994/1‑100 (MQ=255) gTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCt > 1:5720533/1‑100 (MQ=255) gTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCt > 1:5424578/1‑100 (MQ=255) gTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGG‑AATTCTa > 1:2172214/1‑100 (MQ=255) ccaCATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTTACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCt > 1:4692635/3‑100 (MQ=255) aCATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTaa > 1:3277667/1‑100 (MQ=255) aCATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTaa > 1:4295969/1‑100 (MQ=255) aTGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGc > 1:4241965/1‑100 (MQ=255) cTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTc > 1:492361/1‑100 (MQ=255) aaaGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCa > 1:3049060/1‑100 (MQ=255) aaaGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCa > 1:3744294/1‑100 (MQ=255) aaaGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCa > 1:266150/1‑100 (MQ=255) aaaGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCa > 1:4829521/1‑100 (MQ=255) aaaGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCa > 1:5459678/1‑100 (MQ=255) acagccccgACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGa > 1:1419910/9‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:4550442/1‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:1753974/1‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:3886499/1‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:5163835/1‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:1531090/1‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:1493905/1‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:3587552/1‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:647733/1‑100 (MQ=255) cATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAAttt > 1:1038807/1‑100 (MQ=255) tGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTtctc > 1:829640/1‑100 (MQ=255) cgACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTtctc > 1:3627092/2‑100 (MQ=255) gACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGGATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTcc > 1:3686990/1‑100 (MQ=255) aCGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGGTAAGGTTCCAGAATTTCTccc > 1:3438551/1‑100 (MQ=255) cAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTaa > 1:880970/1‑100 (MQ=255) gcccAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATa > 1:1168914/3‑100 (MQ=255) aTCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATa > 1:5396157/1‑100 (MQ=255) ccAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATaaa > 1:1813254/1‑100 (MQ=255) ccAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATaaa > 1:3347142/1‑100 (MQ=255) ggAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGAt > 1:5070991/1‑100 (MQ=255) ccttGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAgt > 1:1694382/3‑100 (MQ=255) ttCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGttt > 1:1606979/2‑100 (MQ=255) gTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGttt > 1:4967217/1‑100 (MQ=255) ccTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTc > 1:1128861/2‑100 (MQ=255) ccTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTc > 1:1941558/2‑100 (MQ=255) aagccccTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTc > 1:1271286/6‑100 (MQ=255) cTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGATTTCTAAGCATCCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAACTTGATAAGTGTTTCt > 1:1566930/1‑100 (MQ=255) cTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCt > 1:4869902/1‑100 (MQ=255) cTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCt > 1:2953765/1‑100 (MQ=255) cTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCt > 1:2220813/1‑100 (MQ=255) atGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCt > 1:2402135/2‑100 (MQ=255) tGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTa > 1:3511206/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGGTAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:1776171/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:5031085/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:3249375/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:1216060/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:2122615/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:3936424/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:2472479/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:4109777/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:4154925/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:2046935/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:798225/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:2858142/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:2781536/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:1857225/1‑100 (MQ=255) gACCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGACAAGTGTTTCTaa > 1:2609266/1‑100 (MQ=255) cgtgtggTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaa > 1:4374861/7‑100 (MQ=255) aCCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaa > 1:4749946/1‑100 (MQ=255) aCCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaa > 1:3715198/1‑100 (MQ=255) aCCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaa > 1:1000957/1‑100 (MQ=255) aCCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaa > 1:5593746/1‑100 (MQ=255) aCCTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaa > 1:2451149/1‑100 (MQ=255) ccTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaaa > 1:3121021/1‑100 (MQ=255) ccTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaaa > 1:5535623/1‑100 (MQ=255) acTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTaaaa > 1:776206/2‑100 (MQ=255) cTAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAt > 1:4621231/1‑100 (MQ=255) tAGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAtt > 1:1992654/1‑100 (MQ=255) agacAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGTAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:4022568/4‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGTGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:5621320/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAGCCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:5197050/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:964472/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:728553/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:5791522/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:5347081/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:5272128/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:1666726/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:4790791/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:4662874/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:4470783/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:34018/1‑100 (MQ=255) aGTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAAttt > 1:3011282/1‑100 (MQ=255) gTCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTc > 1:926726/1‑100 (MQ=255) ctCAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTc > 1:2557529/2‑100 (MQ=255) cAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTCTa > 1:5316525/1‑100 (MQ=255) cAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTCTa > 1:3469079/1‑100 (MQ=255) cAACTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTCTa > 1:2877295/1‑100 (MQ=255) aaCTTTGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTCTAc > 1:3833960/1‑100 (MQ=255) acagggCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTCTACt > 1:3773159/6‑100 (MQ=255) ttGCGGGGGGAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTCTACTTGt > 1:250531/1‑100 (MQ=255) | AATGTACATGTAATATATTTGAGCTAAAGCTCATTGACGCAGTGGTTGACTGGTCATCCAATGGAGAATTGTCTGACCTAGTCAACTTTGCGGGGGAAATTCTAAGCAACCTAGATAAGGTTCCAGAATTTCTCCCTAAGAAACACTAATCAATAAATTGATAAGTGTTTCTAAAATTTCTACTTGTTT > NC_007793/1231236‑1231424 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |