| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,214,895 | A→T | E277V (GAA→GTA) | SAUSA300_RS06005 → | methionyl‑tRNA formyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,214,895 | 0 | A | T | 99.6% | 731.5 / ‑5.2 | 246 | E277V (GAA→GTA) | SAUSA300_RS06005 | methionyl‑tRNA formyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (227/18); total (228/18) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
TACGATGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGAAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAACACACTAGTAGGGAAGAA > NC_007793/1214798‑1214991 | aCGATGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGc > 1:4113878/1‑100 (MQ=255) aCGATGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGc > 1:1255056/1‑100 (MQ=255) aCGATGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGc > 1:665093/1‑100 (MQ=255) aCGATGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGc > 1:3692959/1‑100 (MQ=255) aCGATGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGc > 1:1970430/1‑100 (MQ=255) aCGATGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACCAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGc > 1:4395766/1‑100 (MQ=255) aTGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGt > 1:2618912/1‑100 (MQ=255) gCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTg > 1:330210/1‑100 (MQ=255) gCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTg > 1:4884032/1‑100 (MQ=255) tGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGat > 1:5358873/1‑100 (MQ=255) agaCTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGatat > 1:1142441/1‑100 (MQ=255) gcTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGc > 1:1595702/2‑100 (MQ=255) aataaGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAAt > 1:3826140/1‑100 (MQ=255) aataaGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAAt > 1:226243/1‑100 (MQ=255) aataaGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAAt > 1:5468738/1‑100 (MQ=255) aataaGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAAt > 1:5591742/1‑100 (MQ=255) aataaGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTCGCAATTAAAGATATGCAAt > 1:5640434/1‑100 (MQ=255) aTAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTg > 1:5344332/1‑100 (MQ=255) tAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTgg > 1:181747/1‑100 (MQ=255) tAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTgg > 1:1993081/1‑100 (MQ=255) tAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTgg > 1:3669205/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGGAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:1001100/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:3406132/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:2015261/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:3141841/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:4846469/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:2535411/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:1754342/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:1698268/1‑100 (MQ=255) aaaCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTggg > 1:475128/1‑100 (MQ=255) gtgtgCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaa > 1:5523010/5‑100 (MQ=255) gcGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaa > 1:2458080/2‑100 (MQ=255) ccGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaa > 1:5648678/2‑100 (MQ=255) aCGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaa > 1:3873816/1‑100 (MQ=255) ctaGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaaa > 1:5744458/3‑100 (MQ=255) cGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaaa > 1:3914571/1‑100 (MQ=255) cGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaaa > 1:2657644/1‑100 (MQ=255) caGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaaaa > 1:596082/2‑100 (MQ=255) aggCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaaaa > 1:374670/3‑100 (MQ=255) aGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaaaaa > 1:3461538/1‑100 (MQ=255) aGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTCGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaaaaa > 1:4184172/1‑100 (MQ=255) gCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAag > 1:5277406/1‑100 (MQ=255) gCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAag > 1:5103468/1‑100 (MQ=255) gCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCACTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTgagatcgga > 1:4229851/1‑95 (MQ=255) ccTGGTACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGCGAAAAaga > 1:3286927/1‑100 (MQ=255) ccTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAaga > 1:3429217/1‑100 (MQ=255) cTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAagag > 1:852029/1‑100 (MQ=255) cTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAagag > 1:5405789/1‑100 (MQ=255) cTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAagag > 1:1913812/1‑100 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGCCTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgaga > 1:2702172/1‑100 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGagatcggaa > 1:2846164/1‑92 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgaga > 1:2989150/1‑100 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgaga > 1:879065/1‑100 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgaga > 1:5000251/1‑100 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgaga > 1:4967754/1‑100 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgaga > 1:18045/1‑100 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgaga > 1:3957453/1‑100 (MQ=255) tGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgaga > 1:2103030/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAGATGATAATGTAGCTGTTGCATTTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAgagac > 1:3294222/1‑99 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGaaagatcgga > 1:3608998/1‑93 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:5572288/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:1953203/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:3272462/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:762828/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:2471030/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:1796193/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:4633857/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:1641377/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:1500452/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:1434950/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:217525/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:693981/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGCTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGaa > 1:2087270/1‑100 (MQ=255) ggAACCATTATAGAAACGACT‑AAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAAt > 1:4491233/1‑100 (MQ=255) aaCCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATg > 1:1056010/1‑100 (MQ=255) aaCCATTATAGAAACGACT‑‑AAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGtt < 1:69711/100‑1 (MQ=255) aCCATTATAGAAACGACT‑AAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGtt < 1:2364877/100‑1 (MQ=255) ccATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGtt < 1:3443553/100‑1 (MQ=255) ccATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGtt < 1:4438911/100‑1 (MQ=255) ccATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGtt < 1:2065726/100‑1 (MQ=255) ccATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGtt < 1:910882/100‑1 (MQ=255) taGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGc > 1:2288704/1‑100 (MQ=255) aGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGcc > 1:378984/1‑100 (MQ=255) gAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCa < 1:4597140/100‑1 (MQ=255) aaaaGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAgt > 1:5050107/1‑100 (MQ=255) ttaGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAgtg > 1:5246850/3‑100 (MQ=255) caaGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAgtg > 1:809957/2‑100 (MQ=255) aaaGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAgtg > 1:2161953/1‑100 (MQ=255) aGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAgtggt > 1:5029433/1‑100 (MQ=255) gCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAgtggtg > 1:2942974/1‑100 (MQ=255) gttgCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAaca > 1:3042253/1‑100 (MQ=255) tgCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAacaca > 1:4314957/1‑100 (MQ=255) tgCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGCGCGCAAAacaca > 1:4403535/1‑100 (MQ=255) gCTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAacacac > 1:939836/1‑100 (MQ=255) gCTACAAATGATAATGTAGCTGGTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAacacac > 1:226914/1‑100 (MQ=255) cTACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAacacaac < 1:5131117/100‑3 (MQ=255) tACAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAACACACta > 1:551456/1‑100 (MQ=255) ctcAAATGATAATGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAACACACta > 1:1104784/3‑100 (MQ=255) aaTGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAACACACTAGTAGGgaaga > 1:3568515/1‑100 (MQ=255) aTGTAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAACACACTAGGAGGgaagat > 1:277418/1‑99 (MQ=255) | TACGATGCTGAACTCGTTGAGACTAATAAGATAAACGAGCCTGGAACCATTATAGAAACGACTAAAAAAGCCATTATTGTTGCTACAAATGATAATGAAGCTGTTGCAATTAAAGATATGCAATTAGCTGGGAAAAAGAGAATGTTAGCTGCCAATTATTTAAGTGGTGCGCAAAACACACTAGTAGGGAAGAA > NC_007793/1214798‑1214991 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |