| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,195,971 | T→C | I115T (ATC→ACC) | SAUSA300_RS05925 → | aspartate carbamoyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,195,971 | 0 | T | C | 99.0% | 512.6 / ‑4.2 | 195 | I115T (ATC→ACC) | SAUSA300_RS05925 | aspartate carbamoyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base C (191/1); total (194/1) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
ATGACACATGTAAAACTTTAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACATCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATGGATATTTTGAAGG > NC_007793/1195875‑1196067 | tgtgcaTGTAAAACTTTAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCaa > 1:62482/5‑100 (MQ=255) gACACATGTAAAACTTTAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCaa > 1:3830773/1‑100 (MQ=255) gACACATGTAAAACTTTAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCaa > 1:2476449/1‑100 (MQ=255) gACACATGTAAAACTTTAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCaa > 1:5489775/1‑100 (MQ=255) ataTGTAAAACTTTAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTg > 1:4380187/3‑100 (MQ=255) cTTTAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTgt < 1:5546909/100‑2 (MQ=255) tAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGa > 1:167115/1‑100 (MQ=255) tAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATCAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGtag > 1:664217/1‑98 (MQ=255) aGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGGATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTggcaga > 1:1540776/1‑96 (MQ=255) aGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGAt > 1:125182/1‑100 (MQ=255) agtggTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATg > 1:486713/5‑100 (MQ=255) tcttGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGt > 1:3059091/3‑100 (MQ=255) tttGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTg > 1:2136592/2‑100 (MQ=255) gctGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACACCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTg > 1:4644194/3‑100 (MQ=255) cttGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTg > 1:5511256/2‑100 (MQ=255) cctGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTg > 1:3954104/3‑100 (MQ=255) aTTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGGCATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGGAGTg > 1:4286324/1‑100 (MQ=255) ttGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTgg > 1:4565307/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:4648932/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:3907274/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:4205710/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:2942888/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:2736673/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:2666065/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:351063/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:3542401/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:2595549/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:446734/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:195587/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:1272712/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:188796/1‑100 (MQ=255) tGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGa > 1:1658960/1‑100 (MQ=255) ggCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGac > 1:3855646/1‑100 (MQ=255) ggCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGac > 1:1040594/1‑100 (MQ=255) ggCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGac > 1:5653611/1‑100 (MQ=255) ggCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGac > 1:80700/1‑100 (MQ=255) ggCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGac > 1:4116567/1‑100 (MQ=255) ggCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAAGGCTGGAGAtcggaagagca > 1:4507090/1‑90 (MQ=255) ggCTGCGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGac > 1:3212854/1‑100 (MQ=255) gtgATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGacaaca > 1:3436365/1‑100 (MQ=255) gATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATc > 1:2506483/1‑100 (MQ=255) tAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTa > 1:3335394/1‑100 (MQ=255) tAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTa > 1:5282651/1‑100 (MQ=255) tAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTa > 1:2360091/1‑100 (MQ=255) aGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAGTTTTAGCGAATATTCACACACCAAATGCGAATGCTTGTGATGGAGGTGGACCAGCTACAACACAAAGCTTAc > 1:4700491/1‑100 (MQ=255) aGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTAc > 1:3035809/1‑100 (MQ=255) aGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTAc > 1:1784946/1‑100 (MQ=255) aGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTAc > 1:1624993/1‑100 (MQ=255) aGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTAc > 1:2764477/1‑100 (MQ=255) aGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTAc > 1:4347871/1‑100 (MQ=255) aGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTAc > 1:814268/1‑100 (MQ=255) aGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAA‑ACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACt > 1:3637534/1‑100 (MQ=255) gACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACt > 1:1245940/1‑100 (MQ=255) cATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTg > 1:1931882/1‑100 (MQ=255) ctCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGa > 1:5208779/2‑100 (MQ=255) tCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGAt > 1:4501066/1‑100 (MQ=255) taataaCTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATg > 1:2245985/1‑100 (MQ=255) aataaCTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGa > 1:2966851/1‑100 (MQ=255) gcttactaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGa > 1:562202/4‑100 (MQ=255) aaCTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGa > 1:3558815/1‑100 (MQ=255) aaCTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGa > 1:4007984/1‑100 (MQ=255) aaCTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGa > 1:520835/1‑100 (MQ=255) aaCTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGa > 1:5754471/1‑100 (MQ=255) aaCTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGCTTACTTGATTTAATGACGa > 1:4577405/1‑100 (MQ=255) aaCTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGCGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGa > 1:5110153/1‑100 (MQ=255) ctactaTGAAAAATTAGCGAATATTGACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGata > 1:5703394/1‑100 (MQ=255) tactaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatat > 1:3800603/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACATCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:594500/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGGCGaagat > 1:2167762/1‑96 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGAcagatcg > 1:370264/1‑94 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACgcagat > 1:5056494/1‑95 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:447811/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:2070279/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:543757/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:1708522/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:3142680/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:5145163/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:3278292/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:1415041/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatata > 1:3960002/1‑100 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGaagat > 1:5539875/1‑96 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAAAGACGagatc > 1:5441948/1‑99 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGAAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGagatc > 1:721782/1‑99 (MQ=255) actaTGAAAAATTAGAGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGaagat > 1:2056877/1‑96 (MQ=255) taTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGatagatc > 1:1085337/1‑99 (MQ=255) aTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACgcagatcgg > 1:137826/1‑92 (MQ=255) aTGAAAAATTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATga > 1:4038556/1‑100 (MQ=255) aTGAAAAATTAGCGAATATTAACA‑CCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATgaa > 1:2706448/1‑100 (MQ=255) aaTTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATGTgaagagat > 1:2851727/1‑97 (MQ=255) aTTAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGGCAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAatat > 1:4959980/1‑100 (MQ=255) tAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATgg > 1:1355594/1‑100 (MQ=255) tAGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGAGATCGgaagagcacac > 1:2916368/1‑94 (MQ=255) aaGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATgaagacagatc > 1:4943918/2‑94 (MQ=255) aGCGAATATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATGGa > 1:73751/1‑100 (MQ=255) aaTATTAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATAGataga > 1:1851730/1‑98 (MQ=255) gtgcaaCACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATGGatagatc > 1:3441861/5‑96 (MQ=255) gtgacacCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATGGagatcggaa > 1:490035/4‑95 (MQ=255) tAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATGGATATTTTGaa > 1:2431909/1‑100 (MQ=255) tAACACCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATGGATATTTTGaa > 1:2013218/1‑100 (MQ=255) acacCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATGGATATTTTGAAgg > 1:1468938/1‑100 (MQ=255) | ATGACACATGTAAAACTTTAGAAAGTATTGGCTGTGATTTATTAGTCATTAGACATCCGTTTAATAACTACTATGAAAAATTAGCGAATATTAACATCCCAATTGCGAATGCTGGTGATGGTAGTGGACAACATCCAACACAAAGTTTACTTGATTTAATGACGATATATGAAGAATATGGATATTTTGAAGG > NC_007793/1195875‑1196067 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |