| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 1,092,439 | G→C | G143A (GGA→GCA) | SAUSA300_RS05365 → | dihydrolipoamide dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 1,092,439 | 0 | G | C | 99.7% | 1828.6 / ‑4.9 | 667 | G143A (GGA→GCA) | SAUSA300_RS05365 | dihydrolipoamide dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base C (660/4); total (663/4) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 667 total aligned reads displayed.
TAACATCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGGAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAGGTGCTTTAAACTTACAAGAAGT > NC_007793/1092347‑1092535 | tAACATCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCAtt > 1:3985457/1‑100 (MQ=255)tAACATCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCAtt > 1:5763253/1‑100 (MQ=255)aaaCATCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCAtt > 1:4549734/2‑100 (MQ=255) aaCATCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCAtcg > 1:553547/1‑98 (MQ=255) aaCATCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTg > 1:2165484/1‑100 (MQ=255) aCATCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCAtcac > 1:471104/1‑97 (MQ=255) ctCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATCGCaa > 1:954295/2‑100 (MQ=255) tCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAAc > 1:525816/1‑100 (MQ=255) tAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGt > 1:1276092/1‑100 (MQ=255) tAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGt > 1:3417363/1‑100 (MQ=255) aGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCa < 1:2282923/100‑1 (MQ=255) tagAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGATCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAAAAAGTTCAAg > 1:2420672/3‑100 (MQ=255) aaGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATCGCAACAgatcggaagag > 1:3281751/1‑90 (MQ=255) tAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAAt > 1:4078011/1‑100 (MQ=255) aaCAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAAtt > 1:1774936/1‑100 (MQ=255) aGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAAt > 1:885654/1‑100 (MQ=255) tACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCgg > 1:535906/1‑100 (MQ=255) tACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCgg > 1:310474/1‑100 (MQ=255) tACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCgg > 1:1979159/1‑100 (MQ=255) tACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCgg > 1:1659644/1‑100 (MQ=255) tACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCgg > 1:2871752/1‑100 (MQ=255) aCGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAGATTCCTAATTTCAAATTCGGt > 1:5462940/1‑100 (MQ=255) aCGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGt > 1:4953219/1‑100 (MQ=255) aCGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGt > 1:5484368/1‑100 (MQ=255) aCGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGt > 1:2933205/1‑100 (MQ=255) aCGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGt > 1:1575368/1‑100 (MQ=255) aCGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGt > 1:1000354/1‑100 (MQ=255) aCGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTCTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGt > 1:3681020/1‑100 (MQ=255) gtgtTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTaa > 1:3455912/1‑100 (MQ=255) gtTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAAc > 1:3653249/1‑100 (MQ=255) gtATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACg > 1:282314/2‑100 (MQ=255) ctATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACg > 1:4159805/2‑100 (MQ=255) ctATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACg > 1:520067/2‑100 (MQ=255) aaaTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACg > 1:4933487/3‑100 (MQ=255) tgtGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:3756668/3‑100 (MQ=255) tATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:4787728/1‑100 (MQ=255) tATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:4815840/1‑100 (MQ=255) tATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:3186859/1‑100 (MQ=255) tATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:5624695/1‑100 (MQ=255) tATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:3515694/1‑100 (MQ=255) tATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:122552/1‑100 (MQ=255) gaTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:2261627/2‑100 (MQ=255) aaTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgt > 1:447841/2‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACTACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:5565478/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGTTTCACGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTCAACgtg > 1:4594946/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:1041625/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:5718030/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:3903139/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:754188/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:109375/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:1360971/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:1840732/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:2676449/1‑100 (MQ=255) aTGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtg > 1:3161848/1‑100 (MQ=255) tGGACGCAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtgt > 1:663610/1‑100 (MQ=255) tGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtgt > 1:3830768/1‑100 (MQ=255) tGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtgt > 1:2537560/1‑100 (MQ=255) tGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtgt > 1:260713/1‑100 (MQ=255) tGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtgt > 1:2954934/1‑100 (MQ=255) tGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACgtgt > 1:4496056/1‑100 (MQ=255) tGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGATAAACgtgt > 1:5100674/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACTAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTaaagatcgg > 1:775856/1‑94 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:2658186/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:580364/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:1528036/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:5139159/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:5016369/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:1439789/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:4857455/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:4250092/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:2357177/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:4650245/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:1701291/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:301850/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:2092777/1‑100 (MQ=255) ggACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGtt > 1:4384150/1‑100 (MQ=255) gACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTa > 1:4418088/1‑100 (MQ=255) gACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTa > 1:2035849/1‑100 (MQ=255) gACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTa > 1:639457/1‑100 (MQ=255) aCGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTAt > 1:354105/1‑100 (MQ=255) aCGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTAt > 1:5398754/1‑100 (MQ=255) aCGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTAt > 1:1880576/1‑100 (MQ=255) aaaGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGAc > 1:3368609/1‑100 (MQ=255) taaaggacaAACATACAACTTTAAAAAGGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCa > 1:4342931/7‑100 (MQ=255) cagCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCa > 1:2223721/2‑100 (MQ=255) agCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCaa > 1:2469207/1‑100 (MQ=255) agCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCaa > 1:4295830/1‑100 (MQ=255) agCGCACAAACACACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCaa > 1:3716734/1‑100 (MQ=255) gcgcACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAAc > 1:4439795/1‑100 (MQ=255) acgcACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAAc > 1:5164413/2‑100 (MQ=255) cgcACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGAcacacag > 1:4187202/1‑97 (MQ=255) cgcACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACAAATTGAAATTCATAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACa > 1:825033/1‑100 (MQ=255) agcACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACa > 1:5288533/2‑100 (MQ=255) gcACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAg > 1:5320567/1‑100 (MQ=255) gcACAAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAg > 1:2569781/1‑100 (MQ=255) ccacaAACATACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAg > 1:3596734/2‑100 (MQ=255) ctACAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAGGTGCTTTa > 1:5667806/2‑100 (MQ=255) aCAACTTTAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAGGTGCTTTaaa > 1:5419153/1‑100 (MQ=255) tAAAAATGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAGGTGCTTTAAACTTACaa > 1:2802239/1‑100 (MQ=255) aaaaTGCAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAGGTGCTTTAAACTTACaaga > 1:3306750/1‑100 (MQ=255) | TAACATCGTTAAAGGTGAAGCATATTTCGTAGATAACAATAGCTTACGTGTTATGGACGAAAAGAGCGCACAAACATACAACTTTAAAAATGGAATCATTGCAACAGGTTCAAGACCAATTGAAATTCCTAATTTCAAATTCGGTAAACGTGTTATCGACTCAACAGGTGCTTTAAACTTACAAGAAGT > NC_007793/1092347‑1092535 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |