| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 838,102 | A→G | intergenic (+100/+216) | SAUSA300_RS04050 → / ← SAUSA300_RS04055 | sporulation regulator WhiA/tRNA‑Arg |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 838,102 | 0 | A | G | 100.0% | 21.4 / NA | 10 | intergenic (+100/+216) | SAUSA300_RS04050/SAUSA300_RS04055 | sporulation regulator WhiA/tRNA‑Arg |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (10/0); total (10/0) | |||||||||||
TAAGAAGGTGTTTTTGGTAGTGAATTATCAAAAACACTTTTTTTATGATTAAAAAGTGTTTAATGAATAATAGTCGACTAACTATTAAATTGAGCTGGAAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTGGTCATAAGAAAATATGAAT > NC_007793/838004‑838196 | acagaagGTGTTTTTGGTAGTGAATTATCAAAAACAC‑TTTTTTATGATTAAAAAGTGTTTAATGAATAATAGTCGACTAACTATTAAATTGAGCTGGgaa > 1:5116628/3‑100 (MQ=255) aagaagGTGTTTTTGGTAGTGAATTATCAAAAACAC‑TTTTTTATGATTAAAAAGTGTTTAATGAATAATAGTCGACTAACTATTAAATTGAGCTGGGAAg > 1:3951451/1‑100 (MQ=255) ggTGAATTATCAAAAACAC‑TTTTTTATGATTAAAAAGTGTTTAATGAATAATAGTCGACTAACTATTAAATTGAGCTGGGAAGTTTAATGAAGGAAATTc > 1:5215327/2‑100 (MQ=255) gatggaacGACTAACTATTAAATTGAGCTGGGAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTAt > 1:5697584/8‑100 (MQ=255) gACTAACTATTAAATTGAGCTGGGAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTgg > 1:5464464/1‑100 (MQ=255) aactaTTAAATTGAGCTGGGAAGTTTAATGAAGGATATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTGGTCAt > 1:3788877/1‑100 (MQ=255) aactaTTAAATTGAGCTGGGAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTGGTCAt > 1:4561105/1‑100 (MQ=255) aaaTTGAGCTGGGAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTGGTCATAAGaaaa > 1:1980031/1‑100 (MQ=255) aaTTGAGCTGGGAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTGGTCATAAGAAAat > 1:3951937/1‑100 (MQ=255) tGAGCTGGGAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTGGTCATAAGAAAATATg > 1:1879845/1‑100 (MQ=255) gCTGGGAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTGGTCATAAGAAAATATGAAt > 1:5047140/1‑100 (MQ=255) | TAAGAAGGTGTTTTTGGTAGTGAATTATCAAAAACACTTTTTTTATGATTAAAAAGTGTTTAATGAATAATAGTCGACTAACTATTAAATTGAGCTGGAAAGTTTAATGAAGGAAATTCAATAACCAAGTGATGCCTAATTTTCTCATTAAATAGCATCATATGTATCAATTTGGTCATAAGAAAATATGAAT > NC_007793/838004‑838196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |