| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 796,278 | C→G | intergenic (+39/‑79) | SAUSA300_RS03845 → / → SAUSA300_RS03850 | ribonucleotide‑diphosphate reductase/ribonucleotide‑diphosphate reductase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 796,278 | 0 | C | G | 99.4% | 2864.5 / ‑0.5 | 985 | intergenic (+39/‑79) | SAUSA300_RS03845/SAUSA300_RS03850 | ribonucleotide‑diphosphate reductase/ribonucleotide‑diphosphate reductase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/0); new base G (966/11); total (973/12) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1004 total aligned reads displayed.
TTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAAC > NC_007793/796182‑796377 | ttACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGgtct > 1:1132724/1‑100 (MQ=255)ttACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGgtct > 1:3320528/1‑100 (MQ=255) tactatactaGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTg > 1:792903/1‑100 (MQ=255) tactatactaGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTg > 1:3085362/1‑100 (MQ=255) atactaGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAAtt > 1:3951833/1‑100 (MQ=255) gctaGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAg > 1:3688366/2‑100 (MQ=255) aGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAg > 1:5468562/1‑100 (MQ=255) aGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAg > 1:2391860/1‑100 (MQ=255) aGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAg > 1:1552419/1‑100 (MQ=255) aGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAg > 1:4105455/1‑100 (MQ=255) aataaatTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAgatg > 1:5094369/1‑100 (MQ=255) taatTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGAtt > 1:597855/2‑100 (MQ=255) attaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACt > 1:2161251/1‑100 (MQ=255) attaAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACt > 1:3807667/1‑100 (MQ=255) taAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGc > 1:4571107/1‑100 (MQ=255) aGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTa > 1:652906/1‑100 (MQ=255) aGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTa > 1:3638510/1‑100 (MQ=255) aGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCACCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTa > 1:131110/1‑100 (MQ=255) caagtgggaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATg > 1:3578248/8‑100 (MQ=255) ctAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGt > 1:1668415/2‑100 (MQ=255) agaagaATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCt > 1:4220941/1‑100 (MQ=255) aagaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGt > 1:3199192/1‑100 (MQ=255) aagaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGt > 1:2495621/1‑100 (MQ=255) aagaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGt > 1:4622298/1‑100 (MQ=255) agaaTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTa > 1:3899647/1‑100 (MQ=255) caTGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTAtt > 1:954162/2‑100 (MQ=255) aaTGTACAAGTTGGTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTAtt > 1:5782825/1‑100 (MQ=255) ttGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTAttt > 1:2677980/2‑100 (MQ=255) gtGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTAttt > 1:4169213/2‑100 (MQ=255) tGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTg > 1:5533646/1‑100 (MQ=255) tGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTg > 1:4478726/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTATATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:4393241/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAATCAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:2839739/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCTTCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:4789381/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:2332634/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:3376529/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:1978482/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:1745591/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:2045659/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:5051120/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:149050/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:2944450/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:4429343/1‑100 (MQ=255) gTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGt > 1:4998110/1‑100 (MQ=255) aCAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCa > 1:1172138/1‑100 (MQ=255) ttgttCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAattat > 1:2425807/1‑100 (MQ=255) tctatctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAg > 1:3747860/1‑100 (MQ=255) tgctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTaa > 1:2730748/3‑100 (MQ=255) atctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTaa > 1:2267638/1‑100 (MQ=255) atctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTaa > 1:4824728/1‑100 (MQ=255) atctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTaa > 1:3726551/1‑100 (MQ=255) atctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTaa > 1:2114656/1‑100 (MQ=255) atctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTaa > 1:89767/1‑100 (MQ=255) atctaACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTaa > 1:288134/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAACCAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:739257/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACact > 1:5702140/1‑98 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:1820605/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:2220748/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:4728862/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:4684455/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:1426788/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:2616815/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:2758626/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:1069869/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:4256195/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:208323/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:3150192/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:5158008/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:5274994/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:843509/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:1782929/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAta > 1:1634383/1‑99 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGCCAATTATTGAGCAACAtt > 1:2559598/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATAATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:5425134/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGGCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAtt > 1:1218830/1‑100 (MQ=255) aaCAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACAta > 1:3431456/1‑99 (MQ=255) gTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGaaa > 1:1357779/1‑100 (MQ=255) aaTGACAAACAGCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTatat > 1:403384/1‑100 (MQ=255) cggggCTAATCATCTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGAt > 1:1391607/5‑100 (MQ=255) catcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGtaaga > 1:5234202/1‑96 (MQ=255) actcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGtcaga > 1:670094/3‑96 (MQ=255) ttcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAAtt > 1:3512966/2‑100 (MQ=255) ctcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAAtt > 1:158851/2‑100 (MQ=255) ctcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAAtt > 1:1906645/2‑100 (MQ=255) tcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGccgcagatcg > 1:5648079/1‑91 (MQ=255) tcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTgcaagatc > 1:5326284/1‑93 (MQ=255) tcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTg > 1:1250208/1‑100 (MQ=255) gcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTagatc > 1:4532757/2‑96 (MQ=255) gcTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAACTGTTagatc > 1:3034223/2‑96 (MQ=255) ccTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTgagagatc > 1:5384313/2‑93 (MQ=255) acTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTg > 1:3861820/2‑100 (MQ=255) cTGGTCTGAATTAGCAGTTGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAACTGTTagatcg > 1:1693398/1‑95 (MQ=255) cTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATTTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTgg > 1:4314691/1‑100 (MQ=255) cTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTgccaaagat > 1:558411/1‑92 (MQ=255) cTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTTTTagatcg > 1:3005475/1‑95 (MQ=255) cTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTagatcg > 1:436933/1‑95 (MQ=255) cTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTagatcg > 1:1015783/1‑95 (MQ=255) cTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTgg > 1:4968939/1‑100 (MQ=255) cTGGTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGCTagatcg > 1:3244155/1‑95 (MQ=255) ctctGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAac > 1:4902183/1‑100 (MQ=255) | TTACTATACTAGAAATAAATTATTAAGTGTAGAAGAATGTACAAGTTGTTCTATCTAACAATTAAATGTTGAAAATGACAAACAGCTAATCATCTGCTCTGAATTAGCAGATGATTAGACTGCTATGTCTGTATTTGTCAATTATTGAGTAACATTACAGGAGGAAATTATATTCATGATAGCTGTTAATTGGAAC > NC_007793/796182‑796377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |