| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 705,053 | A→G | intergenic (+150/‑209) | SAUSA300_RS03375 → / → SAUSA300_RS03380 | antibiotic ABC transporter ATP‑binding protein/nucleoside permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 705,053 | 0 | A | G | 100.0% | 45.4 / NA | 18 | intergenic (+150/‑209) | SAUSA300_RS03375/SAUSA300_RS03380 | antibiotic ABC transporter ATP‑binding protein/nucleoside permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (16/2); total (16/2) | |||||||||||
TGTGGCACATTGATGGATATAGATGTTAATAAATTGCTTCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTAAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTGTAGCCACG > NC_007793/704962‑705143 | tgtgGCACATTGATGGATATAGATGTTAATAAATTGCTTCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAATg > 1:3602558/1‑100 (MQ=255) tgGCACATTGATGGATATAGATGTTAATAAATTGCTTCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAATGaa > 1:750004/1‑100 (MQ=255) ggCACATTGATGGATATAGATGTTAATAAATTGCTTCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAATGaaa > 1:813269/1‑100 (MQ=255) tGGATATAGATGTTAATAAATTGCTTCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATAtttt > 1:3960213/1‑100 (MQ=255) aGATGTTAATAAATTGCTTCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGaaaa > 1:1745051/1‑100 (MQ=255) tGCTTCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCCCATggag > 1:277060/1‑98 (MQ=255) tCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAGTGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTataat > 1:2694634/1‑100 (MQ=255) cAAGCTTTTGACTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATACTCATGGTataata > 1:3282318/1‑100 (MQ=255) cTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAG‑AAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGc > 1:2106635/1‑100 (MQ=255) tACGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACt > 1:3732548/1‑100 (MQ=255) tACGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACt > 1:1721348/1‑100 (MQ=255) aCGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTg > 1:382543/1‑100 (MQ=255) aCGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTg > 1:4191176/1‑100 (MQ=255) aCGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTg > 1:639557/1‑100 (MQ=255) aCGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTg > 1:2457007/1‑100 (MQ=255) aCGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTg > 1:988224/1‑100 (MQ=255) cGACATAATAATTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTGt < 1:649478/100‑1 (MQ=255) ataatTCTTGAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTGTAGCCACg < 1:3465182/100‑1 (MQ=255) | TGTGGCACATTGATGGATATAGATGTTAATAAATTGCTTCAAGCTTTTGTCTATTTTAAATCATTTGAGAAGTTACGACATAATAATTCTTAAATTAATGAAATCGATATTTTAAGAAAAAAATGCTCATGGTATAATACAAGTTATAAGCAAACATACATATATTAAATACTGTAGCCACG > NC_007793/704962‑705143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |