D66 :: BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_007793	678,967	G→C	intergenic (‑87/+861)	SAUSA300_RS03250 ← / ← SAUSA300_RS03255	transcriptional regulator/membrane protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_007793	678,967	0	G	C	100.0%	362.0 / NA	128	intergenic (‑87/+861)	SAUSA300_RS03250/SAUSA300_RS03255	transcriptional regulator/membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (8/120); total (8/120)

Only 100 of 128 total aligned reads displayed.

GTAATTGCCATGTTTAAAACCTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATGTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGTAAACA  >  NC_007793/678870‑679061

gTAATTGCCATGTTTAAAACCTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCtt                                                                                              <  1:2510981/100‑1 (MQ=255)

              ttccgatctccTCTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:301678/91‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTTTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAGTATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:1995063/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTTTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:131684/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTGTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:4533188/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:975948/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:2557599/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:2998516/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:3208542/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:2063581/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:3352895/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:3393785/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:1574015/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:5034624/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGCCATAATTTTGc                                                                                <  1:3427212/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTACTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:1377584/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCTACTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:4632327/94‑1 (MQ=255)

              tccgatcTCCCCATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:446266/94‑1 (MQ=255)

              gatctccTCGCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:631357/95‑1 (MQ=255)

              gatctccTCCCTGTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:3839143/95‑1 (MQ=255)

              gatctccTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:5356657/95‑1 (MQ=255)

              cgatctcTCCTTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:397979/94‑1 (MQ=255)

              cgatctcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:1090526/94‑1 (MQ=255)

              ccgatcttCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGc                                                                                <  1:1783681/93‑1 (MQ=255)

               gatctttCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCa                                                                               <  1:2922220/94‑1 (MQ=255)

               ccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCa                                                                               <  1:331210/95‑1 (MQ=255)

               ccgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCa                                                                               <  1:3619123/95‑1 (MQ=255)

                cgatcTCCCTGTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAt                                                                              <  1:4171956/96‑1 (MQ=255)

                cgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAt                                                                              <  1:337762/96‑1 (MQ=255)

                cgatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATGGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCag                                                                              <  1:1779745/96‑2 (MQ=255)

                atctcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAt                                                                              <  1:2240204/96‑1 (MQ=255)

                aaaCCTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAt                                                                              <  1:1613231/100‑1 (MQ=255)

                 tctgtCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAtt                                                                             <  1:1862699/96‑1 (MQ=255)

                 gatcTCCCTGTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAtt                                                                             <  1:3376312/97‑1 (MQ=255)

                 gatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAtt                                                                             <  1:670111/97‑1 (MQ=255)

                 gatcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAtt                                                                             <  1:2229128/97‑1 (MQ=255)

                 atcttCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAtt                                                                             <  1:3510777/96‑1 (MQ=255)

                 atctctccTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAtt                                                                             <  1:5247907/94‑1 (MQ=255)

                 aaCCTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAtt                                                                             <  1:3981927/100‑1 (MQ=255)

                  atcTCCCTGTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCAttt                                                                            <  1:3380960/98‑2 (MQ=255)

                  atcTCCCTCTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTa                                                                            <  1:3649717/98‑1 (MQ=255)

                  atcTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGcgcct                                                                            <  1:5294818/98‑5 (MQ=255)

                  aCCTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTa                                                                            <  1:2634398/100‑1 (MQ=255)

                   tcTCCCAGTTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTag                                                                           <  1:5698219/99‑2 (MQ=255)

                   ccTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTaa                                                                           <  1:3589429/100‑1 (MQ=255)

                      ccgatcttGATGTATCTTTCTCGATACATTTTCCCTATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATATATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATa                                                                        <  1:4778558/94‑1 (MQ=255)

                                  cATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTaaa                                                            <  1:1293868/100‑1 (MQ=255)

                                                  tttGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCta                                            >  1:4229258/1‑100 (MQ=255)

                                                   ttgcgtgATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCtat                                           >  1:5156424/7‑100 (MQ=255)

                                                    tGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCtatt                                          >  1:3578147/1‑100 (MQ=255)

                                                     gCCCGGTAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCtatta                                         >  1:116404/1‑100 (MQ=255)

                                                        cGATAATATATTGGTATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTAttt                                      <  1:2317277/100‑1 (MQ=255)

                                                        cGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTAttt                                      <  1:3161302/100‑1 (MQ=255)

                                                        cGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTAttt                                      <  1:3107705/100‑1 (MQ=255)

                                                        cGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTAttt                                      <  1:5603192/100‑1 (MQ=255)

                                                        cGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTAttt                                      <  1:2269257/100‑1 (MQ=255)

                                                            aataTATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGtt                                  <  1:1996338/100‑1 (MQ=255)

                                                               atatTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAAt                               <  1:2800358/100‑1 (MQ=255)

                                                                  ttGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATtat                            <  1:4423250/100‑1 (MQ=255)

                                                                  ttGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATtat                            <  1:3053973/100‑1 (MQ=255)

                                                                  ttGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATtat                            <  1:4273230/100‑1 (MQ=255)

                                                                  ttGATATCTAATCTTTATCTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATtat                            <  1:4281796/100‑1 (MQ=255)

                                                                    gATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATtatag                          <  1:775308/100‑2 (MQ=255)

                                                                     atatCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAAttggcct                         <  1:926452/100‑6 (MQ=255)

                                                                      tatCTAATCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACt                        <  1:472176/100‑1 (MQ=255)

                                                                           aaTCTTTATTTATTATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTa                   >  1:5769480/1‑100 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAGTg             <  1:4100121/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATg             <  1:834207/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATg             <  1:852160/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATg             <  1:4765901/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATg             <  1:4757833/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATg             <  1:1078190/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATg             <  1:2450018/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATg             <  1:2670283/100‑1 (MQ=255)

                                                                                 tatttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATg             <  1:1748348/100‑1 (MQ=255)

                                                                                   tttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgag           <  1:2354838/100‑1 (MQ=255)

                                                                                   tttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgag           <  1:953341/100‑1 (MQ=255)

                                                                                   tttattATAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATACTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgag           <  1:4269637/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:4571061/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:2498763/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:69205/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:2682751/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:3511619/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:3813311/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:5395056/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:1292048/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:501673/100‑1 (MQ=255)

                                                                                    ttattaTAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgaga          <  1:4609260/100‑1 (MQ=255)

                                                                                     tattatAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgagcg         <  1:5463710/100‑3 (MQ=255)

                                                                                      agtataGATATCTTAGGCATAATTGTGCATTAAATAAGTGTTAGTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgagcac        <  1:5596344/98‑4 (MQ=255)

                                                                                       ttatAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGt       <  1:1168969/100‑1 (MQ=255)

                                                                                       ttatAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGt       <  1:800003/100‑1 (MQ=255)

                                                                                       ttatAGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGt       <  1:1294400/100‑1 (MQ=255)

                                                                                        tataGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGTa      <  1:5427568/100‑1 (MQ=255)

                                                                                        tataGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGTa      >  1:2989336/1‑100 (MQ=255)

                                                                                        tataGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGTa      <  1:4880291/100‑1 (MQ=255)

                                                                                         ataGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGTag     <  1:2562205/100‑2 (MQ=255)

                                                                                           aGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATgagagatcgga   <  1:5044940/100‑8 (MQ=255)

                                                                                           aGATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGTaagg   <  1:4156549/100‑3 (MQ=255)

                                                                                            gATATCTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGTAAACa  <  1:2264964/100‑1 (MQ=255)

GTAATTGCCATGTTTAAAACCTCCCTATTTGATGCATCTTGCTCGATACATTTGCCCGATAATATATTGATATCTAATCTTTATTTATTATAGATATGTTAGTCATAATTTTGCATTAAATAAGTTTTATTAAATATATTTAATGCTCTATTATTTAGTTAATTATAACTAATTAAAAATGAGAAGTAAACA  >  NC_007793/678870‑679061

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 20 ≤` `ATCG/ATCG` `< 33 ≤` `ATCG/ATCG` `< 38 ≤` `ATCG/ATCG` `< 39 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`