| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_007793 | 662,512 | C→T | intergenic (+21/‑249) | SAUSA300_RS03160 → / → SAUSA300_RS03165 | hypothetical protein/oxidoreductase ion channel protein IolS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007793 | 662,512 | 0 | C | T | 100.0% | 26.6 / NA | 11 | intergenic (+21/‑249) | SAUSA300_RS03160/SAUSA300_RS03165 | hypothetical protein/oxidoreductase ion channel protein IolS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (8/3); total (8/3) | |||||||||||
AATGGGTTTTTTTCTAGTTAATATAGCTTTAATTATAGATAAAAACATTCATGTCATACTTAAAAACCAATAGAAATTACCAAATTAAATTTGCAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTAAATGTTTTTCAATTTCTGATTCAAAAGTACATGTAATTTAAAGGTCAACGAGCAATCGCGCTATATGCAT > NC_007793/662419‑662607 | taTGGGTTTTTTTCTAGTTAATATAGCTTTAATTATAGATAAAAACATTCATGTCATACTTAAAAACCAATAGAAATTACCAAATTAAATTTGTAATGGc > 1:1991765/2‑100 (MQ=255) tCTAGTTAATATAGCTTTAATTATAGATAAAAACATTCATGTCATACTTAAAAACCAATAGAAATTACCAAATTAAATTTGTAATGGCTTTAATATTGTc > 1:309447/1‑100 (MQ=255) aGTTAATATAGCTTTAATTATAGATAAAAACATTCATGTCATACTTAAAAACCAATAGAAATTACCCAATTAAATTTGTAATGGCTTTAATATTGTCGtt > 1:4992012/1‑100 (MQ=255) aaTATAGCTTTAATTATAGATAAAAACATTCATGTCATACTTAAAAACCAATAGAAATTACCAAATTAAATTTGTAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTa > 1:1705825/1‑100 (MQ=255) ataGCTTTAATTATAGATAAAAACATTCATGTCATACTTAAAAACCAATAGAAATTACCAAATTAAATTTGTAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTAAAt > 1:3834233/1‑100 (MQ=255) tGTCATACTTAAAAACCAATAGAAATTACCAAATTAAATTTGTAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTAAATGTTTTTCAATTTCTGATTCAAAAGTACag < 1:2614029/100‑2 (MQ=255) aaCCAATAGAAATTACCAAATTAAATTTGTAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTAAATGTTTTTCAATTTCTGATTCAAAAGTACATGTAATTTAAAgat > 1:1637092/1‑98 (MQ=255) aaTAGAAATTACCAAATTAAATTTGTAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTAAATGTTTTTCAATTTCTGATTCAAAAGTACATGTAACCTAAAGATcgga > 1:5071787/1‑97 (MQ=255) aCCAAATTAAATTAGTTCTTTCTATAATATTTTCGTTCTTCCATTTTTTTCAATTTCTGATTCCAAAGTACATGTACTTTAAAGGTCAACGAGCAATcgc > 1:3103072/1‑100 (MQ=255) aattTGTAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTAAATGTTTTTCAATTTCTGATTCAAAAGTACATGTAATTTAAAGGTCAACGAGCAATCGCGCTATATGc < 1:2661253/100‑1 (MQ=255) tttGTAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTAAATGTTTTTCAATTTCTGATTCAAAAGTACATGTAATTTAAAGGTCAACGAGCAATCGCGCTATATGCat < 1:1374764/100‑1 (MQ=255) | AATGGGTTTTTTTCTAGTTAATATAGCTTTAATTATAGATAAAAACATTCATGTCATACTTAAAAACCAATAGAAATTACCAAATTAAATTTGCAATGGCTTTAATATTGTCGTTCTTAAATGTTTTTCAATTTCTGATTCAAAAGTACATGTAATTTAAAGGTCAACGAGCAATCGCGCTATATGCAT > NC_007793/662419‑662607 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |